RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 IGSF9Q9P2J2 1179 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 CDH9Q9ULB4 789 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 NME7Q9Y5B8 376 aa26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF197O14709 1029 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR37L1O60883 481 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TACC1O75410 805 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP2F1P24903 491 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R2P41236 205 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 RAP1GAPP47736 663 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 STX17P56962 302 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TDGQ13569 410 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 SPOPLQ6IQ16 392 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM67Q6ZTA4 783 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 LRFN3Q9BTN0 628 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 VRTNQ9H8Y1 702 aa26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ATF6P18850 670 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR15P49685 360 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 SDHAF4Q5VUM1 108 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TCERG1LQ5VWI1 586 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 POTEHQ6S545 545 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 PARM1Q6UWI2 310 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TAS1R2Q8TE23 839 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 GBP4Q96PP9 640 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 CRTAC1Q9NQ79 661 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ASB3Q9Y575 518 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TECTAO75443 2155 aa26.73■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM163BP0C2L3 166 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ENPEPQ07075 957 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 HTR4Q13639 388 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 VEPH1Q14D04 833 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TAF12Q16514 161 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM171BQ6P995 826 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ITIH5Q86UX2 942 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 UBALD2Q8IYN6 164 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 PSMG2Q969U7 264 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC3Q9BY71 257 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 SDCBP2Q9H190 292 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 DPEP3Q9H4B8 488 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM8AQ9HCN3 771 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 NUMBLQ9Y6R0 609 aa26.72■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM221A6NGB7 291 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 A8MXQ7 604 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ANHXE9PGG2 379 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 M0R296 226 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRN2O75325 713 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 MOSPD3O75425 235 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ASS1P00966 412 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 EPHA5P54756 1037 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP27A1Q02318 531 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 SIGLEC14Q08ET2 396 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 MDH1BQ5I0G3 518 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TTI2Q6NXR4 508 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TMC8Q8IU68 726 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 LEMD2Q8NC56 503 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 STKLD1Q8NE28 680 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 TAF4BQ92750 862 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 FGF14Q92915 247 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 MYLPFQ96A32 169 aa26.71■■□□□ 1.87
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PRU2 124 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 NARSO43776 548 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 P4HA1P13674 534 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 GTF2H1P32780 548 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 TEAD2Q15562 447 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 DDR2Q16832 855 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT39Q6A163 491 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 SCN4BQ8IWT1 228 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 SHKBP1Q8TBC3 707 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 IMPG2Q9BZV3 1241 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCB6Q9NP58 842 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 GDE1Q9NZC3 331 aa26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 BICDL2A1A5D9 508 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 STX10O60499 249 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 PAK1Q13153 545 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 C4orf50Q6ZRC1 276 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 SEMA4DQ92854 862 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 NXPE3Q969Y0 559 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSWIM3Q96MP5 696 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 KXD1Q9BQD3 176 aa26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 MICAL2O94851 1124 aa26.68■■□□□ 1.86
HTATSF1-202ENST00000425695 BDNFP23560 247 aa26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms