RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 APBB2Q92870 758 aa25.92■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 PAAF1Q9BRP4 392 aa25.92■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 CCDC189A1A4V9 331 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 FAM170AA1A519 330 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 LSP1P33241 339 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 C2orf54Q08AI8 447 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 PDCLQ13371 301 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 DNAAF5Q86Y56 855 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 ARL8AQ96BM9 186 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 CNTN6Q9UQ52 1028 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 LRPAP1P30533 357 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 MYO1EQ12965 1108 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 TAX1BP1Q86VP1 789 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 PALB2Q86YC2 1186 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 TRIM58Q8NG06 486 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 CASTOR2A6NHX0 329 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.744e-7■■■□□ 17.9
CTU1-201ENST00000421832 LCA5LO95447 670 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 PARNO95453 639 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 CYP11B1P15538 503 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 ZNF394Q53GI3 561 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 RCCD1A6NED2 376 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 KIAA0355O15063 1070 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 B4GALT3O60512 393 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 TIMP1P01033 207 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 CHRNB2P17787 502 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 CLCNKBP51801 687 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 SLC18A3Q16572 532 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 FMNL3Q8IVF7 1028 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 TMEM161AQ9NX61 479 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.89■■□□□ 1.74
CTU1-201ENST00000421832 TCP1P17987 556 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 GATMP50440 423 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 ZNF132P52740 706 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 CRYMQ14894 314 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 MREGQ8N565 214 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 C3orf58Q8NDZ4 430 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 AGPAT1Q99943 283 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 STIM2Q9P246 746 aa25.89■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 INPPL1O15357 1258 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 CSF2RAP15509 400 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 TNNC1P63316 161 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 ORC1Q13415 861 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 C6orf89Q6UWU4 347 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 SPATA4Q8NEY3 305 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 LRRC1Q9BTT6 524 aa25.88■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 ZNF185O15231 689 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 MMEP08473 750 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 VAV2P52735 878 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 LILRA4P59901 499 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 GRIK3Q13003 919 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 CRIPAKQ8N1N5 446 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 TWNKQ96RR1 684 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 CD248Q9HCU0 757 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 TACC1O75410 805 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 RAG1P15918 1043 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 CALRP27797 417 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 CDR1P51861 262 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 KIF5AQ12840 1032 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 CEP85LQ5SZL2 805 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 IQCKQ8N0W5 287 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 WHAMMQ8TF30 809 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 PCDHB18PQ96TA0 734 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 NENFQ9UMX5 172 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 KPNA7A9QM74 516 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 FAM107AO95990 144 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 TAF6P49848 677 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 PDE6CP51160 858 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 FMO1Q01740 532 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 SPA17Q15506 151 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 ZNF280BQ86YH2 543 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 ZNF560Q96MR9 790 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 ZIM3Q96PE6 472 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 RABEP2Q9H5N1 569 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 NAGPAQ9UK23 515 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 PODXLO00592 558 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU1-201ENST00000421832 P4HA1P13674 534 aa25.86■■□□□ 1.73
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