RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 TASP1Q9H6P5 420 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 PPP1R37O75864 691 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 SERPIND1P05546 499 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 PON1P27169 355 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ETFBP38117 255 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 SPDYAQ5MJ70 313 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ELMO2Q96JJ3 720 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 USP32Q8NFA0 1604 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 FRMD3A2A2Y4 597 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 H0Y626 953 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ANGPT2O15123 496 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 MTM1Q13496 603 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 PTK6Q13882 451 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 C4orf33Q8N1A6 199 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 USP38Q8NB14 1042 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 FBXO32Q969P5 355 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 IDI2Q9BXS1 227 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 THAP2Q9H0W7 228 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 REREQ9P2R6 1566 aa10.76□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 PDHXO00330 501 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 SETSIPP0DME0 302 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 INSRRP14616 1297 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 NTRK3Q16288 839 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 LONRF1Q17RB8 773 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 CENPPQ6IPU0 288 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 BHMTQ93088 406 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 OSMRQ99650 979 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 PKD2L2Q9NZM6 624 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ARHGAP10A1A4S6 786 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 SYCE1LA8MT33 242 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 RAD51CO43502 376 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 PMPCBO75439 489 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 SUPT3HO75486 399 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 MYBPC2Q14324 1141 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00523Q86TU6 105 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 FAM71DQ8N9W8 422 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 AKT1S1Q96B36 256 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 CGRRF1Q99675 332 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 TCP11X1B4DZS4 312 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 URODP06132 367 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 GZMAP12544 262 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 CHRM3P20309 590 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ARL4DP49703 201 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 BCAT1P54687 386 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 PTK7Q13308 1070 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 CTXN3Q4LDR2 81 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 RABGAP1LQ5R372 815 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 FKBP1CQ5VVH2 108 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 TTI2Q6NXR4 508 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 SNX5Q9Y5X3 404 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 VWA5AO00534 786 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 GUCY1A3Q02108 690 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 DMTNQ08495 405 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 DACT2Q5SW24 774 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 SV2AQ7L0J3 742 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 GPC2Q8N158 579 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 TAS1R2Q8TE23 839 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 UCMAQ8WVF2 138 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 YME1L1Q96TA2 773 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 VIPAS39Q9H9C1 493 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 HPSEQ9Y251 543 aa10.75□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 FAM47DPA6NHR8 397 aa10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 EGFRP00533 1210 aa10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 CYP11B1P15538 503 aa10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 ITGA8P53708 1063 aa10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 AP2B1P63010 937 aa10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 RGS9BPQ6ZS82 235 aa10.74□□□□□ -0.69
ZNF548-202ENST00000366197 SPATA21Q7Z572 469 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms