RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 LOXL3P58215 753 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 SATB1Q01826 763 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 IQCB1Q15051 598 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 LONRF3Q496Y0 759 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 MVB12AQ96EY5 273 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 DKK3Q9UBP4 350 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.79□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 VPS53Q5VIR6 699 aa5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 MAP3K14Q99558 947 aa5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 HESX1Q9UBX0 185 aa5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.78□□□□□ -1.48
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 THP07101 528 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 CHRM3P20309 590 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 VIPR2P41587 438 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF81P51508 661 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 TFF2Q03403 129 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 PLS1Q14651 629 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 FANCBQ8NB91 859 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 SLC35A4Q96G79 324 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 QSOX1O00391 747 aa5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 PPM1DO15297 605 aa5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 AHSGP02765 367 aa5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 CYP2C9P11712 490 aa5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 NEK2P51955 445 aa5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 PTPROQ16827 1216 aa5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 HPS3Q969F9 1004 aa5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 LATS1O95835 1130 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 JUPP14923 745 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 PCSK6P29122 969 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 KCNJ5P48544 419 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 GTF2H3Q13889 308 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 E2F2Q14209 437 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 MTHFD1LQ6UB35 978 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 SERHLQ9NQF3 203 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 RNF7Q9UBF6 113 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.75□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 E2F8A0AVK6 867 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 OFD1O75665 1012 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 DNAJB5O75953 348 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 LRPAP1P30533 357 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 CYP2C18P33260 490 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF134P52741 427 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 SOX8P57073 446 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 TUBA4AP68366 448 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF425Q6IV72 752 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 DDB2Q92466 427 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.74□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 WDR91A4D1P6 747 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 DCLK1O15075 740 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 GRPP07492 148 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 HDCP19113 662 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 KELP23276 732 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 WNT3P56703 355 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 PROSER3Q2NL68 480 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 MTX3Q5HYI7 312 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 TREML2Q5T2D2 321 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 MAVSQ7Z434 540 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.73□□□□□ -1.49
PDCL2-201ENST00000295645 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms