RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294161.10

TTC9C-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC9C, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9C-201ENST00000294161 AMHR2Q16671 573 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 IQSEC1Q6DN90 963 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CEP120Q8N960 986 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ATG4AQ8WYN0 398 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TFAP2BQ92481 460 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ACAP3Q96P50 834 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CCDC77Q9BR77 488 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 C2CD2Q9Y426 696 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 RASGRF2O14827 1237 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 HMGCRP04035 888 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ITGB3P05106 788 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 NFICP08651 508 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 VDRP11473 427 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 RAD23BP54727 409 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 DGKDQ16760 1214 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 DUSP28Q4G0W2 176 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 GPR142Q7Z601 462 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 NLRP14Q86W24 1093 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 WDTC1Q8N5D0 677 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TTC13Q8NBP0 860 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SIX4Q9UIU6 781 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 GGA2Q9UJY4 613 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 POLIQ9UNA4 740 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 DERAQ9Y315 318 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 MGAMO43451 1857 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 MCM3APO60318 1980 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TLDC2A0PJX2 215 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 GMNCA6NCL1 334 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CAND2O75155 1236 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 FAM107AO95990 144 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 FGFR4P22455 802 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PSMA2P25787 234 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ADCYAP1R1P41586 468 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ITGA8P53708 1063 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 STILQ15468 1287 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CNGA2Q16280 664 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SKIDA1Q1XH10 827 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 FOXR1Q6PIV2 292 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 HPDLQ96IR7 371 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TTC9C-201ENST00000294161 E7EVH7 732 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 LIASO43766 372 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 CILPO75339 1184 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 SHBGP04278 402 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 IQCF3P0C7M6 154 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 SNX16P57768 344 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 MYO1EQ12965 1108 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 IRF5Q13568 498 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 LLGL1Q15334 1064 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 GRIK4Q16099 956 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 MFSD5Q6N075 450 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 RELL1Q8IUW5 271 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 SERPINB12Q96P63 405 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 BRCA2P51587 3418 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 TTC4O95801 387 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 VTNP04004 478 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF286BP0CG31 522 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 DESP17661 470 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 IVDP26440 423 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 GRM5P41594 1212 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 GRB14Q14449 540 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 TMEM192Q8IY95 271 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 CCT8L2Q96SF2 557 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 KATNBL1Q9H079 304 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 DPP3Q9NY33 737 aa15.57■□□□□ 0.08
TTC9C-201ENST00000294161 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms