RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 MMEL1Q495T6 779 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PGBD4Q96DM1 585 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 UBOX5O94941 541 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 EGFRP00533 1210 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 PYGMP11217 842 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 SULT1E1P49888 294 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 UGCGQ16739 394 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 AADACL2Q6P093 401 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 CCNYL1Q8N7R7 359 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 RDM1Q8NG50 284 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 RRAGCQ9HB90 399 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 NPHS2Q9NP85 383 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ATG16L1Q676U5 607 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 KRT35Q92764 455 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 SH3GL2Q99962 352 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ASAP2O43150 1006 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 POLE2P56282 527 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ITIH4Q14624 930 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ARSHQ5FYA8 562 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 DPP3Q9NY33 737 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 CLGNO14967 610 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 PPP1R36Q96LQ0 422 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.81e-10■■■■□ 20.5
ANKRD40-201ENST00000285243 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 GPC2Q8N158 579 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 TRIM4Q9C037 500 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 KIF1AQ12756 1690 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 CCND1P24385 295 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 RFX8Q6ZV50 586 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 NOL4O94818 638 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 BEX3Q00994 111 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM131BQ86XD5 332 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 CEP120Q8N960 986 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 BFARQ9NZS9 450 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 APOL1O14791 398 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 RIPK2O43353 540 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 TADA2AO75478 443 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 NOTUMQ6P988 496 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 SNTG2Q9NY99 539 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 LCA5LO95447 670 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 KNL1Q8NG31 2342 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 KRT38O76015 456 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ZWINTO95229 277 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 NCAM1P13591 858 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 TPI1P60174 286 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 SH2D4BQ5SQS7 431 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 FUKQ8N0W3 1084 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 CNPY4Q8N129 248 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 PGM2Q96G03 612 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 LRRC37A3O60309 1634 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 RARAP10276 462 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 GARTP22102 1010 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD40-201ENST00000285243 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms