RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf74Q6P047 294 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SFR1Q86XK3 245 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CREG2Q8IUH2 290 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC39A11Q8N1S5 342 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC43Q8N309 656 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MYCT1Q8N699 235 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF169Q8NCN4 708 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CASD1Q96PB1 797 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 REEP2Q9BRK0 252 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TIPINQ9BVW5 301 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM107BQ9H098 131 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GANQ9H2C0 597 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PARVGQ9HBI0 331 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 RGS18Q9NS28 235 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 STIM2Q9P246 746 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 WNT16Q9UBV4 365 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SQORQ9Y6N5 450 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ERICH4A6NGS2 130 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF263O14978 683 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SRGAP2O75044 1071 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NOL4O94818 638 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 H2AFZP0C0S5 128 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MYBP10242 640 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT13P13646 458 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNA2P16389 499 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP8P85298 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GUCA2AQ02747 115 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf54Q08AI8 447 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP2R5AQ15172 486 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 LPAL2Q16609 132 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ARSHQ5FYA8 562 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 H2AFVQ71UI9 128 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NIPA1Q7RTP0 329 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR149Q86SP6 731 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 RETREG3Q86VR2 466 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS52Q8N1B4 723 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PJA1Q8NG27 643 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 WHAMMQ8TF30 809 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A17Q8WUG5 538 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC5A5Q92911 643 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 DRC1Q96MC2 740 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PCYT2Q99447 389 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 RIT2Q99578 217 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBP1Q9H171 429 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ST7Q9NRC1 585 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 VAV3Q9UKW4 847 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BQF6 201 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC188H7C350 402 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 EPHB6O15197 1021 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SPTLC1O15269 473 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 PALMO75781 387 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 SRFP11831 508 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 UCHL3P15374 230 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 TGM1P22735 817 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCD1P33897 745 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-201ENST00000264640 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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