RNA–Protein interactions for RNA: YKR055W

RHO4, Transcript of Non-essential small GTPase, yeast

Gene RHO4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RHO4	YKR055W	TRX3	P25372	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	MKK1	P32490	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YKR041W	P36134	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ECM14	P38836	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YEA4	P40004	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	CWP2	P43497	92 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YFR020W	P43600	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	MIC27	P50945	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	INP1	Q03694	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ELP6	Q04868	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ENB1	Q08299	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	FCY1	Q12178	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PCL9	Q12477	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YCR100C	P25606	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YCR085W	P25650	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YIL165C	P40446	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YIR016W	P40572	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	MMS2	P53152	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YGR039W	P53225	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	NAT3	Q06504	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	FIT3	Q08907	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PEX11	Q12462	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
RHO4	YKR055W	GPX1	P36014	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	MID2	P36027	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU13	P38725	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YJL193W	P39542	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	CYB5	P40312	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	TOS2	P50078	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU4	P53427	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU10	Q03050	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	SDC1	Q03323	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	RIM9	Q04734	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	FSH2	Q05015	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YFH1	Q07540	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU20	Q08322	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	ENV10	Q99382	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	COX9	P07255	59 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YMC1	P32331	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	SPS18	P32572	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	FLO5	P38894	1075 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	XBP1	P40489	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	BRR6	P53062	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	SUN4	P53616	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RHO4	YKR055W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHO4	YKR055W	SOD2	P00447	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHO4	YKR055W	REC104	P33323	182 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHO4	YKR055W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RHO4	YKR055W	YBR184W	P38299	523 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHO4	YKR055W	YJR096W	P47137	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHO4	YKR055W	BOL2	P53082	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHO4	YKR055W	CAX4	P53223	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHO4	YKR055W	YGR164W	P53291	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHO4	YKR055W	CRD1	Q07560	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RHO4	YKR055W	HRT1	Q08273	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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