RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W MCH2P36032 473 aa10.78□□□□□ -0.68
SSA4YER103W SRX1P36077 127 aa10.78□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YER079WP40052 210 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YNL198CP40166 100 aa10.78□□□□□ -0.68
SSA4YER103W TRS23Q03784 219 aa10.78□□□□□ -0.68
SSA4YER103W YMR254CQ04838 102 aa10.78□□□□□ -0.68
SSA4YER103W COX1P00401 534 aa10.77□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YPT1P01123 206 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SSA4YER103W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SSA4YER103W SAG1P20840 650 aa10.77□□□□□ -0.69
SSA4YER103W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SSA4YER103W LCL3P53153 274 aa10.77□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YMR210WQ03649 449 aa10.77□□□□□ -0.69
SSA4YER103W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data10.77□□□□□ -0.69not detected
SSA4YER103W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SSA4YER103W SEC72P39742 193 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YFL054CP43549 646 aa10.76□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YDL183CP48569 320 aa10.76□□□□□ -0.69
SSA4YER103W MIC27P50945 234 aa10.76□□□□□ -0.69
SSA4YER103W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SSA4YER103W TIF34P40217 347 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YNR071CP53757 342 aa10.76□□□□□ -0.69
SSA4YER103W ECM18Q04623 453 aa10.76□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YPS3Q12303 508 aa10.76□□□□□ -0.69
SSA4YER103W BOL1Q3E793 110 aa10.76□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YPT53P36019 220 aa10.75□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SSA4YER103W CAB4P53332 305 aa10.75□□□□□ -0.69
SSA4YER103W DYN2Q02647 92 aa10.75□□□□□ -0.69
SSA4YER103W GRE1Q08969 168 aa10.75□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YLR302CO13544 120 aa10.74□□□□□ -0.69
SSA4YER103W IMP1P28627 190 aa10.74□□□□□ -0.69
SSA4YER103W BLM10P43583 2143 aa10.74□□□□□ -0.69
SSA4YER103W RAD23P32628 398 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
SSA4YER103W PFS1P38872 237 aa10.74□□□□□ -0.69
SSA4YER103W COX18P53239 316 aa10.74□□□□□ -0.69
SSA4YER103W THI72Q08579 599 aa10.74□□□□□ -0.69
SSA4YER103W CYC7P00045 113 aa10.73□□□□□ -0.69
SSA4YER103W SAS2P40963 338 aa10.73□□□□□ -0.69
SSA4YER103W CIS3P47001 227 aa10.73□□□□□ -0.69
SSA4YER103W SDS23P53172 527 aa10.73□□□□□ -0.69
SSA4YER103W BRP1P53194 125 aa10.73□□□□□ -0.69
SSA4YER103W PCP1P53259 346 aa10.73□□□□□ -0.69
SSA4YER103W PIN2Q12057 282 aa10.73□□□□□ -0.69
SSA4YER103W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data10.73□□□□□ -0.69not detected
SSA4YER103W YMR316C-AI2HB70 103 aa10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W NNK1P36003 928 aa10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YKR073CP36153 106 aa10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YML079WQ03629 201 aa10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W DAL82P21705 255 aa10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W FEN2P25621 512 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YBR220CP38318 560 aa10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W POP3P53833 195 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W DPP1Q05521 289 aa10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W ISU2Q12056 156 aa10.72□□□□□ -0.69
SSA4YER103W BRR2P32639 2163 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
SSA4YER103W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
SSA4YER103W MRS3P10566 314 aa10.71□□□□□ -0.69
SSA4YER103W ECM33P38248 429 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
SSA4YER103W ATP19P81451 68 aa10.71□□□□□ -0.69
SSA4YER103W SCW10Q04951 389 aa10.71□□□□□ -0.69
SSA4YER103W YFL068WP0CX99 160 aa10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YLL066W-AP0CY00 160 aa10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YLL067W-AP0CY01 160 aa10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W ROX3P25046 220 aa10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YIL029CP40538 142 aa10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W VPS71Q03433 280 aa10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YIL086CP40503 102 aa10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YPS6P40583 537 aa10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W ATG4P53867 494 aa10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W WIP1Q2V2P8 89 aa10.7□□□□□ -0.7
SSA4YER103W MRS1P07266 363 aa10.69□□□□□ -0.7
SSA4YER103W BET5Q03630 159 aa10.69□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YPR098CQ06089 161 aa10.69□□□□□ -0.7
SSA4YER103W POS5Q06892 414 aa10.69□□□□□ -0.7
SSA4YER103W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W RPL12BP0CX54 165 aa10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W TIR1P10863 254 aa10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YHR173CP38864 112 aa10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W SWS2P53937 143 aa10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W HPF1Q05164 967 aa10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W ADH1P00330 348 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W ATP10P18496 279 aa10.68□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YIL012WP40551 113 aa10.67□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YHP1Q04116 353 aa10.67□□□□□ -0.7
SSA4YER103W UPS1Q05776 175 aa10.67□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YGL258W-AQ3E740 77 aa10.67□□□□□ -0.7
SSA4YER103W YAR068WP39564 161 aa10.66□□□□□ -0.7
SSA4YER103W UBC13P52490 153 aa10.66□□□□□ -0.7
SSA4YER103W RAV2Q03956 351 aa10.66□□□□□ -0.7
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