RNA–Protein interactions for RNA: YCR098C

GIT1, Transcript of Plasma membrane permease, yeast

Gene GIT1, Length 1,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GIT1	YCR098C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	IKI1	P38874	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	PIR5	P46999	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	ABM1	P47146	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	LIP2	Q06005	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	AGC1	Q12482	902 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	TOR1	P35169	2470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	BPH1	P25356	2167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	UPS2	P35200	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	CTR2	P38865	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SPC25	P40014	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	ERG28	P40030	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	MST27	P53176	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YGR050C	P53231	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	DIA1	P54005	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	TMA23	Q03525	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YMR31	P19955	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	CPR5	P35176	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	ECM14	P38836	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YNR066C	P53752	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	FSH2	Q05015	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	HRD1	Q08109	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	ATX2	Q12067	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SPS100	P13130	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	AHT1	P29589	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SHG1	P38337	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	COX14	P39103	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	CRH1	P53301	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	PDR17	P53844	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	MHR1	Q06630	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	CTR3	Q06686	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	APA2	P22108	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SPO13	P23624	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	CDC50	P25656	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	RIB5	P38145	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YBR292C	P38357	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YGR269W	P40326	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	ERG25	P53045	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	LPP1	Q04396	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SNA4	Q07549	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	HTB2	P02294	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	POG1	P40473	351 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	TTI2	P47168	421 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YNL046W	P53956	172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	FCY2	P17064	533 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	SPS18	P32572	300 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YER121W	P40076	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	HHO1	P53551	258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	DYN2	Q02647	92 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YKL187C	P34231	750 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YNL194C	P40169	301 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YPD1	Q07688	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	CRC1	Q12289	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	MEC1	P38111	2368 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	AVT5	P38176	459 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
GIT1	YCR098C	PGD1	P40356	397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	AVO2	Q04749	426 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	POF1	P25576	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YBL059W	P34224	193 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	MIX23	P38162	196 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	VMA21	P41806	77 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	NSE4	P43124	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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