RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	TGFB3	P10600	412 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152		Q3C1V9	767 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEA4	P43358	317 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ASPA	P45381	313 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	SCTR	P47872	440 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	MCL1	Q07820	350 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	EMC1	Q8N766	993 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	CCT6B	Q92526	530 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	CEP83	Q9Y592	693 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	SGK1	O00141	431 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ABLIM1	O14639	778 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	AP3M2	P53677	418 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	TMED2	Q15363	201 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	KCNN1	Q92952	543 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	CENPF	P49454	3210 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	TNNC2	P02585	160 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PSMA2	P25787	234 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	GPC2	Q8N158	579 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ASAP2	O43150	1006 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	BANF1	O75531	89 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5D	P30049	168 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	MNAT1	P51948	309 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	BBOF1	Q8ND07	529 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	RASA4B	C9J798	803 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	RASA4	O43374	803 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	CDH16	O75309	829 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PIAS1	O75925	651 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	KRT3	P12035	628 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PIK3R2	O00459	728 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	SOCS7	O14512	581 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	NFIC	P08651	508 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	LMNB2	Q03252	620 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.8	□□□□□ -0.2

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