RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-259	ENST00000627568	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568		R4GN57	208 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	PATJ	Q8NI35	1801 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	HUS1	O60921	280 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	F13A1	P00488	732 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	CDR1	P51861	262 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	GAREM2	Q75VX8	874 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	HPS3	Q969F9	1004 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	DMD	P11532	3685 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	DPYSL4	O14531	572 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	ATF6	P18850	670 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	CDC25C	P30307	473 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	GPR158	Q5T848	1215 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF233	A6NK53	670 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	ME1	P48163	572 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	RBP5	P82980	135 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	MYL7	Q01449	175 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	SURF1	Q15526	300 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	ATL3	Q6DD88	541 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	ADSSL1	Q8N142	457 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	CLDN23	Q96B33	292 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	L1RE1	Q9UN81	338 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	COL4A2	P08572	1712 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF4-259	ENST00000627568	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	TNNC2	P02585	160 aa		27.57	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	GIPC2	Q8TF65	315 aa		27.57	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		27.57	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		27.57	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		27.57	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	NCAN	O14594	1321 aa		27.57	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	CFAP54	Q96N23	3096 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	MYO1E	Q12965	1108 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	SPATA18	Q8TC71	538 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	FAM3C	Q92520	227 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	FAM84A	Q96KN4	292 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	ACBD6	Q9BR61	282 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	TASP1	Q9H6P5	420 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	INTS13	Q9NVM9	706 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	CFAP45	Q9UL16	551 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	UBE4B	O95155	1302 aa		27.56	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	CHAD	O15335	359 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	CYP4F8	P98187	520 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	UNC13D	Q70J99	1090 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	CXorf38	Q8TB03	319 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	MSANTD3	Q96H12	275 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	OBP2A	Q9NY56	170 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	SIX4	Q9UIU6	781 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		27.54	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	SHISA7	A6NL88	538 aa		27.53	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
TCF4-259	ENST00000627568	PCSK1	P29120	753 aa		27.53	■■■□□ 2

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