RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591085.1

BECN1-217, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 559 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-217ENST00000591085 CDC25CP30307 473 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 PXNP49023 591 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 TUFMP49411 452 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 LIG4P49917 911 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CDR1P51861 262 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CCDC6Q16204 474 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 SLC39A12Q504Y0 691 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ARMCX5Q6P1M9 558 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CD302Q8IX05 232 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CMTM8Q8IZV2 173 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 FAM184AQ8NB25 1140 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 FAM200AQ8TCP9 573 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 BICD1Q96G01 975 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 PLIN2Q99541 437 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 REEP2Q9BRK0 252 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CCSER1Q9C0I3 900 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 GKN1Q9NS71 199 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ODF2LQ9ULJ1 636 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CCL26Q9Y258 94 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 DERAQ9Y315 318 aa10□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ZZEF1O43149 2961 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CACNA1GO43497 2377 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 AKAP3O75969 853 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 F11P03951 625 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 SCP2P22307 547 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 NLRP12P59046 1061 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 SMARCB1Q12824 385 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 RUNX3Q13761 415 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 VEPH1Q14D04 833 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 STPG1Q5TH74 334 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 IL31Q6EBC2 164 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 MSTO1Q9BUK6 570 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 EBF3Q9H4W6 596 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 DSEQ9UL01 958 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 C2CD2Q9Y426 696 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 SPEGQ15772 3267 aa9.99□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 TISP43B9A030 160 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 K7ENM7 598 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CYB561D2O14569 222 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ATG13O75143 517 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 RNF40O75150 1001 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 TADA3O75528 432 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 EGFP01133 1207 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ARSAP15289 507 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 MPLP40238 635 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 GTF2BQ00403 316 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 PTPAQ15257 358 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 PLK5Q496M5 336 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 WSCD1Q658N2 575 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 GIPC2Q8TF65 315 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ASB7Q9H672 318 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 TDP1Q9NUW8 608 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 TMLHEQ9NVH6 421 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.98□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.97□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 SOBPA7XYQ1 873 aa9.97□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.97□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 SLC26A4O43511 780 aa9.97□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 TRAK2O60296 914 aa9.97□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 CCDC192P0DO97 292 aa9.97□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 AVPR1AP37288 418 aa9.97□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 GPR15P49685 360 aa9.97□□□□□ -0.81
BECN1-217ENST00000591085 ACOT2P49753 483 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms