RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNF8Q96H20 258 aa22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GJB6O95452 261 aa22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RARGP13631 454 aa22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRM5P41594 1212 aa22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAP1GAPP47736 663 aa22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LLGL1Q15334 1064 aa22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT71Q3SY84 523 aa22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BBOF1Q8ND07 529 aa22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CXorf38Q8TB03 319 aa22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HPDLQ96IR7 371 aa22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.58■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CILPO75339 1184 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT1P04264 644 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPN7P35236 360 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GJC1P36383 396 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC114Q96M63 670 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SDCBP2Q9H190 292 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 O00370 1275 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TJP3O95049 919 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATF2P15336 505 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP1A2P50993 1020 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDH8P55286 799 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.22e-6■■■□□ 17.1
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DPP3Q9NY33 737 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DERAQ9Y315 318 aa22.56■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VDRP11473 427 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYNCQ9H7C4 482 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRIN2DO15399 1336 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT3P12035 628 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF365Q70YC5 407 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC89Q8N998 374 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPN18Q99952 460 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 F8VP50 259 aa22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HMGCRP04035 888 aa22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDR1P51861 262 aa22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OGDHQ02218 1023 aa22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CNGA2Q16280 664 aa22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMA2P25787 234 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADCY8P40145 1251 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADCY2Q08462 1091 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 INCA1Q0VD86 236 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYO1EQ12965 1108 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDCLQ13371 301 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIF12Q96FN5 646 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MIS12Q9H081 205 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SETD4Q9NVD3 440 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NRCAMQ92823 1304 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MGAMO43451 1857 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A6NJR5 290 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MICAL2O94851 1124 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT7P08729 469 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms