RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 ORC1Q13415 861 aa25.42■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 SLC9A7Q96T83 725 aa25.42■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 PCDHB8Q9UN66 801 aa25.42■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa25.42■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 COL4A6Q14031 1691 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 CARNS1A5YM72 827 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 F8W810 466 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 VDRP11473 427 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 CHRNB2P17787 502 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 BRD2P25440 801 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 FMO1Q01740 532 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 CYP27A1Q02318 531 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 TNIP3Q96KP6 325 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 CWH43Q9H720 699 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.41■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 GJB5O95377 273 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 CYP11A1P05108 521 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 TYMPP19971 482 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 SGO2Q562F6 1265 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 NAGPAQ9UK23 515 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 GABRDO14764 452 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 PDGFRBP09619 1106 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA1328Q86T90 577 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 ACOT1Q86TX2 421 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 OSTM1Q86WC4 334 aa25.4■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 TSC2P49815 1807 aa25.39■■□□□ 1.66
MEIS3-204ENST00000558555 MAGEA1P43355 309 aa25.39■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 LRCH3Q96II8 777 aa25.39■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF558Q96NG5 402 aa25.39■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa25.39■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF263O14978 683 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 LAG3P18627 525 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 LMO2P25791 158 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 PCSK1P29120 753 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 STILQ15468 1287 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 CRYBG2Q8N1P7 616 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 TFAP2BQ92481 460 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 MARCH5Q9NX47 278 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 INSL6Q9Y581 213 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 CEP83Q9Y592 693 aa25.38■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 ESPNB1AK53 854 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 SYN3O14994 580 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 PBX3P40426 434 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 OVOS1Q6IE37 1185 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 HERC6Q8IVU3 1022 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 KCND1Q9NSA2 647 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 NME7Q9Y5B8 376 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 GZMAP12544 262 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 FUT10Q6P4F1 479 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 KCNT2Q6UVM3 1135 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 PCDHB18PQ96TA0 734 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 DPEP3Q9H4B8 488 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 AAASQ9NRG9 546 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 PCDHGC3Q9UN70 934 aa25.37■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 SLC34A2O95436 690 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 VAV2P52735 878 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 CNGA2Q16280 664 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 FIBCD1Q8N539 461 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 RAD9AQ99638 391 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 CDH9Q9ULB4 789 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 NENFQ9UMX5 172 aa25.36■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.35■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 TMCO5BA8MYB1 307 aa25.35■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 HCRTO43612 131 aa25.35■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 LSM8O95777 96 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 TKTP29401 623 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 SHHQ15465 462 aa25.35■■□□□ 1.65
MEIS3-204ENST00000558555 FAM171A1Q5VUB5 890 aa25.35■■□□□ 1.65
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