RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 F13A1P00488 732 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 RBP5P82980 135 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 GAREM2Q75VX8 874 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 GLIS3Q8NEA6 775 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 MTMR12Q9C0I1 747 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.38■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 LMNAP02545 664 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 CDC25CP30307 473 aa23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 FAM3CQ92520 227 aa23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 FAM84AQ96KN4 292 aa23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 TRPV5Q9NQA5 729 aa23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 PIAS3Q9Y6X2 628 aa23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 COL4A3Q01955 1670 aa23.37■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 USP34Q70CQ2 3546 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 TNNC2P02585 160 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 ATF6P18850 670 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 MYL7Q01449 175 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 MYO1EQ12965 1108 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 SURF1Q15526 300 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 CFAP45Q9UL16 551 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 L1RE1Q9UN81 338 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 SCN1AP35498 2009 aa23.36■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 ANK1P16157 1881 aa23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 RPS9P46781 194 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 CYP4F8P98187 520 aa23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 CLDN23Q96B33 292 aa23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 ACBD6Q9BR61 282 aa23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 TASP1Q9H6P5 420 aa23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 HSPBP1Q9NZL4 362 aa23.35■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 CHADO15335 359 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 DUOXA2Q1HG44 320 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 ATL3Q6DD88 541 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 UNC13DQ70J99 1090 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 RDH13Q8NBN7 331 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 RSPRY1Q96DX4 576 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 INTS13Q9NVM9 706 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 GDAP2Q9NXN4 497 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 SIX4Q9UIU6 781 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 FBXO4Q9UKT5 387 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.34■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 NCANO14594 1321 aa23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 CCNE1P24864 410 aa23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 AFMP43652 599 aa23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 LHX1P48742 406 aa23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 HINFPQ9BQA5 517 aa23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CIPC-208ENST00000557115 TSC2P49815 1807 aa23.33■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 KINO60870 393 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 PCSK1P29120 753 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CASP1P29466 404 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 HOXD13P35453 343 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 FCHO2Q0JRZ9 810 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 ZNF528Q3MIS6 628 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SCARA3Q6AZY7 606 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CXorf38Q8TB03 319 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 HPDLQ96IR7 371 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 FNBP1Q96RU3 617 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 IL21Q9HBE4 155 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms