RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RAD50	Q92878	1312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ASB14	A6NK59	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	LINC01387	J3KSC0	135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RFXAP	O00287	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FOXP2	O15409	715 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	B4GALT4	O60513	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ECEL1	O95672	775 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	IGHD	P01880	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FGB	P02675	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	VDR	P11473	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CYP2C9	P11712	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	LTBR	P36941	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DNM2	P50570	870 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PHC1	P78364	1004 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TERF2	Q15554	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF124	Q15973	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RASA4B	C9J798	803 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478		H3BML4	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NFIB	O00712	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RASA4	O43374	803 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CABYR	O75952	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	LRIG2	O94898	1065 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SOD2	P04179	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	POU2F2	P09086	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MTHFD2	P13995	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MX1	P20591	662 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CALML3	P27482	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CHKA	P35790	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NKX3-2	P78367	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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