RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 SV2BQ7L1I2 683 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 NLRX1Q86UT6 975 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PDSS2Q86YH6 399 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 HIPK4Q8NE63 616 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 THTPAQ9BU02 230 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 THAP2Q9H0W7 228 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 H3BSA7 217 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PODXLO00592 558 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 MAGEB2O15479 319 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 CLPTM1O96005 669 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 SMARCA1P28370 1054 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 AMPD3Q01432 767 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 RELAQ04206 551 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 GK3PQ14409 553 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 SPARCL1Q14515 664 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 KIF22Q14807 665 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 GPR153Q6NV75 609 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 UNC13DQ70J99 1090 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 KCNK18Q7Z418 384 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 GIPC3Q8TF64 312 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 CYLDQ9NQC7 956 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ABCB11O95342 1321 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 A0A1W2PPM1 405 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 KLRF2D3W0D1 207 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ZWINTO95229 277 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ALDH2P05091 517 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ENO1P06733 434 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 IDO1P14902 403 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 UQCRBP14927 111 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 TCF3P15923 654 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 SOX11P35716 441 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ITGA8P53708 1063 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 AP2B1P63010 937 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 CYP4A11Q02928 519 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PPATQ06203 517 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PDK4Q16654 411 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 GCNAQ96QF7 691 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 COA1Q9GZY4 146 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ACP6Q9NPH0 428 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 APPL1Q9UKG1 709 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ALG6Q9Y672 507 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 CDH16O75309 829 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 KRT15P19012 456 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PPP1R2P41236 205 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ENTPD1P49961 510 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 CHN2P52757 468 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 KRT17Q04695 432 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 KDSRQ06136 332 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 PTK7Q13308 1070 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 GRB10Q13322 594 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 GRM2Q14416 872 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 LPIN1Q14693 890 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.59□□□□□ -1.03
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