RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 TMC5Q6UXY8 1006 aa35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 CCDC150Q8NCX0 1101 aa35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 SLC7A14Q8TBB6 771 aa35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 PGLYRP2Q96PD5 576 aa35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ADAM7Q9H2U9 754 aa35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 PAPLNO95428 1278 aa35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 SEC24AO95486 1093 aa35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 AFPP02771 609 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 RAP1GAPP47736 663 aa35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CDH8P55286 799 aa35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 ITIH3Q06033 890 aa35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 ANO6Q4KMQ2 910 aa35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 SLC39A12Q504Y0 691 aa35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 TCEAL8Q8IYN2 117 aa35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CDH22Q9UJ99 828 aa35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 MAFFQ9ULX9 164 aa35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 MTMR11A4FU01 709 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 PCSK1P29120 753 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 ELF1P32519 619 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 TSPY1Q01534 308 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 UVSSAQ2YD98 709 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CCDC149Q6ZUS6 474 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 PKMYT1Q99640 499 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 BCO2Q9BYV7 579 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 NIF3L1Q9GZT8 377 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 SNX25Q9H3E2 840 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CYP4F11Q9HBI6 524 aa35.18■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa35.17■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 P4HA2O15460 535 aa35.17■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 PPM1LQ5SGD2 360 aa35.17■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 RTL10Q7L3V2 364 aa35.17■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 OR6B3Q8NGW1 331 aa35.17■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 SUSD6Q92537 303 aa35.17■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 HOXA9P31269 272 aa35.16■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 WDR44Q5JSH3 913 aa35.16■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CES5AQ6NT32 575 aa35.16■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 GPR149Q86SP6 731 aa35.16■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CRISPLD1Q9H336 500 aa35.16■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 TMLHEQ9NVH6 421 aa35.16■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CDH9Q9ULB4 789 aa35.16■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 PRRG1O14668 218 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 PDGFRBP09619 1106 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 MYL5Q02045 173 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 ATAD1Q8NBU5 361 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 SYT15Q9BQS2 421 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 KCNJ18B7U540 433 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 ATP2C2O75185 946 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 WEE2P0C1S8 567 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 IL9P15248 144 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CDR1P51861 262 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 SMARCB1Q12824 385 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 KCNJ12Q14500 433 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CCDC142Q17RM4 750 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CDKAL1Q5VV42 579 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 LMO3Q8TAP4 145 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 TATDN2Q93075 761 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 FAXDC2Q96IV6 333 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 PRKD2Q9BZL6 878 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 GTF3C4Q9UKN8 822 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 INSL5Q9Y5Q6 135 aa35.15■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 BMP1P13497 986 aa35.14■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CETN1Q12798 172 aa35.14■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 DUSP4Q13115 394 aa35.14■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 MAN2A1Q16706 1144 aa35.14■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 TTC9BQ8N6N2 239 aa35.14■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa35.14■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 CRTAC1Q9NQ79 661 aa35.14■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 FANCLQ9NW38 375 aa35.14■■■■□ 3.22
CHKB-210ENST00000484266 C5orf42Q9H799 3197 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 MYBPHLA2RUH7 354 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 A8MXQ7 604 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 NCAPHQ15003 741 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 TCP11X2Q5H9J9 407 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 FAM171BQ6P995 826 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 BPIFA3Q9BQP9 254 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 DPEP3Q9H4B8 488 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 CYP3A43Q9HB55 503 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 FAM50BQ9Y247 325 aa35.13■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
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