RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 C1QL3Q5VWW1 255 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 RNF44Q7L0R7 432 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 YAF2Q8IY57 180 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MB21D1Q8N884 522 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 GNRHR2Q96P88 292 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 STK31Q9BXU1 1019 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPON1Q9HCB6 807 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PDS5BQ9NTI5 1447 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM234BA2RU67 622 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PODXLO00592 558 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 NPHP1O15259 732 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCP110O43303 1012 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRIM13O60858 407 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MFAP3LO75121 409 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CYP2C9P11712 490 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ACVR2AP27037 513 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 GABRB3P28472 473 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCT5P48643 541 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 RENBPP51606 427 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CHN2P52757 468 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 FSTL1Q12841 308 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 FOXL1Q12952 345 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 HTR3DQ70Z44 454 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MED25Q71SY5 747 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SYT12Q8IV01 421 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 FUKQ8N0W3 1084 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SYT8Q8NBV8 401 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MUL1Q969V5 352 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TOX2Q96NM4 488 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 NEU1Q99519 415 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDYLQ9Y232 598 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 LGALS16A8MUM7 142 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ACKR2O00590 384 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 NPC1O15118 1278 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 KCNQ3O43525 872 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 RASSF9O75901 435 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 INMTO95050 263 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 NDST3O95803 873 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CKBP12277 381 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CNR2P34972 360 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 RABGGTBP53611 331 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PIGFQ07326 219 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 FOXO1Q12778 655 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 BIRC3Q13489 604 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 RAB30Q15771 203 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PFKFB4Q16877 469 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 AMOTQ4VCS5 1084 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 METRNLQ641Q3 311 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 KRT28Q7Z3Y7 464 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 D2HGDHQ8N465 521 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MIEF2Q96C03 454 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRRC46Q96FV0 321 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MOGAT1Q96PD6 335 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 RGL1Q9NZL6 768 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 POGKQ9P215 609 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SMARCA4P51532 1647 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms