RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 GKN1Q9NS71 199 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 GMEB2Q9UKD1 530 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.75□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 K7ENM7 598 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 CYB561D2O14569 222 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 TRAK2O60296 914 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 EGFP01133 1207 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ALDH1A3P47895 512 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 CSRP2Q16527 193 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 PPM1JQ5JR12 505 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 KBTBD6Q86V97 674 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 YAF2Q8IY57 180 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 RAD54LQ92698 747 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 SLC22A12Q96S37 553 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 OBP2AQ9NY56 170 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 KCND2Q9NZV8 630 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ASB3Q9Y575 518 aa11.74□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 LAMA1P25391 3075 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 AXIN1O15169 862 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 HOXA6P31267 233 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 CASP5P51878 434 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 NRLP54845 237 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 NLRP12P59046 1061 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ZXDBP98169 803 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 TMEM196Q5HYL7 178 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 TXNDC8Q6A555 127 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 NETO1Q8TDF5 533 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 E2F7Q96AV8 911 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 EPSTI1Q96J88 318 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 EBF3Q9H4W6 596 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 PARVGQ9HBI0 331 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 HSFX1Q9UBD0 423 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 NME7Q9Y5B8 376 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 EML5Q05BV3 1969 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 DCLK1O15075 740 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 FAM13AO94988 1023 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ODC1P11926 461 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 RAP1GAPP47736 663 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 GALK1P51570 392 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 LRRC32Q14392 662 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 SFR1Q86XK3 245 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 MSANTD3Q96H12 275 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 DPP3Q9NY33 737 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 SIX4Q9UIU6 781 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 L1RE1Q9UN81 338 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 PTPRJQ12913 1337 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 DENND4CQ5VZ89 1909 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 A0A087X0B3 334 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 MYMKA6NI61 221 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 LRP3O75074 770 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 CYP2F1P24903 491 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 MCM2P49736 904 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 TAF6P49848 677 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 MESP2Q0VG99 397 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 RUNX3Q13761 415 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 PTPAQ15257 358 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 DDR2Q16832 855 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 GAB4Q2WGN9 574 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ADALQ6DHV7 355 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms