RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 HEY1Q9Y5J3 304 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG6Q9Y672 507 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 GAKO14976 1311 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TPPPO94811 219 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 BCRP11274 1271 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MUTP22033 750 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3CAP42336 1068 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT17Q04695 432 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SFT2D3Q587I9 215 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NCANO14594 1321 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PDGFRBP09619 1106 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PCSK6P29122 969 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINB8P50452 374 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 AP2B1P63010 937 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 POU5F1BQ06416 359 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DLG1Q12959 904 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGA9Q13797 1035 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC7BQ86TV6 843 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC6Q86X45 466 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM11Q96F44 468 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TINF2Q9BSI4 451 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TRABDQ9H4I3 376 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CYLDQ9NQC7 956 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMCX1Q9P291 453 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 POTEMA6NI47 508 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 POTECB2RU33 542 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM253P0C7T8 217 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT15P19012 456 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP7A1P22680 504 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGA8P53708 1063 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 BTKQ06187 659 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK6Q16659 721 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 LPCAT4Q643R3 524 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT77Q7Z794 578 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO27Q8NI29 283 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 FNDC8Q8TC99 324 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NLRP7Q8WX94 980 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PANX3Q96QZ0 392 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BRJ5 948 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ADCY3O60266 1144 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 AQP4P55087 323 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ASPHQ12797 758 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PDK3Q15120 406 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CLUL1Q15846 466 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NADK2Q4G0N4 442 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TRABD2AQ86V40 505 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PDSS2Q86YH6 399 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP24Q8N264 748 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 IRGQQ8WZA9 623 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAML1Q92585 1016 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD54LQ92698 747 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC77Q9BR77 488 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 STK17AQ9UEE5 414 aa8.82□□□□□ -1
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