RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 CD302Q8IX05 232 aa24.57■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 C1orf54Q8WWF1 131 aa24.57■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 CYP3A43Q9HB55 503 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 F8VP50 259 aa24.57■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 CPXM1Q96SM3 734 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 ERP44Q9BS26 406 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 MICAL2O94851 1124 aa24.56■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 RAB17Q9H0T7 212 aa24.56■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 RNF39Q9H2S5 420 aa24.56■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 TRIM32Q13049 653 aa24.56■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 SNX1Q13596 522 aa24.56■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.56■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 ZIM3Q96PE6 472 aa24.56■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 LHX5Q9H2C1 402 aa24.56■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 SNX24Q9Y343 169 aa24.56■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 FSCN2O14926 492 aa24.55■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 HSF2BPO75031 334 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 FLT3LGP49771 235 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 SGO2Q562F6 1265 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 DUPD1Q68J44 220 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 C12orf29Q8N999 325 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 C3orf20Q8ND61 904 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.527e-7■■■■□ 25.5
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FAAP20-209ENST00000428120 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 RALAP11233 206 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 TM4SF4P48230 202 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 CYP1B1Q16678 543 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.55■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 PARP2Q9UGN5 583 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 FAM187AA6NFU0 413 aa24.54■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 ERBB2P04626 1255 aa24.54■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.54■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 FAM118BQ9BPY3 351 aa24.54■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 PI4K2BG5E9Z4 385 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 PIK3R2O00459 728 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.522e-7■■■□□ 18.9
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FAAP20-209ENST00000428120 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP58Q5T655 872 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 SESTD1Q86VW0 696 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 RUFY1Q96T51 708 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 CHST7Q9NS84 486 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 CYP3A5P20815 502 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 MAN1A1P33908 653 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 MREGQ8N565 214 aa24.53■■□□□ 1.52
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FAAP20-209ENST00000428120 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 CNTN3Q9P232 1028 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 DERAQ9Y315 318 aa24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 GNAT1P11488 350 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 HOXC8P31273 242 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 CAP1Q01518 475 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 ALS2CLQ60I27 953 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 EMC1Q8N766 993 aa24.52■■□□□ 1.52
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