RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 TLR10Q9BXR5 811 aa21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CDC23Q9UJX2 597 aa21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 HUS1O60921 280 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 FAM163BP0C2L3 166 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 MMP8P22894 467 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CYP2C18P33260 490 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 SGO2Q562F6 1265 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CEP83Q9Y592 693 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 SAR1BQ9Y6B6 198 aa21.57■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CYB561D2O14569 222 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 FTCDO95954 541 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 RRM1P23921 792 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 NUP85Q9BW27 656 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 A8MXQ7 604 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 MICAL2O94851 1124 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 ACOT1Q86TX2 421 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 SYCE1Q8N0S2 351 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 C12orf29Q8N999 325 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 SENP8Q96LD8 212 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 UROC1Q96N76 676 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 ABCB6Q9NP58 842 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 SNX12Q9UMY4 172 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.56■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 HCRTO43612 131 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 NCK2O43639 380 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 PRLRP16471 622 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 LMO2P25791 158 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 DSC1Q08554 894 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 STILQ15468 1287 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 C2CD6Q53TS8 623 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 OSTM1Q86WC4 334 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 RABGGTAQ92696 567 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.55■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 GABRDO14764 452 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CLTBP09497 229 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CAPN2P17655 700 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 DAAM2Q86T65 1068 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 SNX25Q9H3E2 840 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 TSC2P49815 1807 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 WSCD1Q658N2 575 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 URGCPQ8TCY9 931 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.54■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 M0QYV0 167 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 B4GALT3O60512 393 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 B3GAT3O94766 335 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 GPD2P43304 727 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 LIN9Q5TKA1 542 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 VWCEQ96DN2 955 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 HYOU1Q9Y4L1 999 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.53■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 SRGAP2O75044 1071 aa21.52■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 DDHD2O94830 711 aa21.52■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 CALB1P05937 261 aa21.52■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 PDGFRBP09619 1106 aa21.52■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 PAX3P23760 479 aa21.52■■□□□ 1.04
HDDC3-202ENST00000394272 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms