RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 MCEEQ96PE7 176 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 FAM153AQ9UHL3 310 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 IPPQ9Y573 584 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 SNX9Q9Y5X1 595 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.95■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 C9orf57Q5W0N0 161 aa18.95■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 CAPNS2Q96L46 248 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 IP6K2Q9UHH9 426 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.623e-8■□□□□ 8.2
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ACTB-201ENST00000331789 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 NKX3-2P78367 333 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 CNGA2Q16280 664 aa18.94■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 VIPAS39Q9H9C1 493 aa18.94■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.94■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 DCUN1D2Q6PH85 259 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 SESTD1Q86VW0 696 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 CAVIN3Q969G5 261 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 C18orf8Q96DM3 657 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 NT5C1AQ9BXI3 368 aa18.94■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 DR1Q01658 176 aa18.93■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 C12orf29Q8N999 325 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 C3orf20Q8ND61 904 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 HERPUD2Q9BSE4 406 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa18.93■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 F8VP50 259 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 PIRO00625 290 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 DAPK3O43293 454 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 KCNE1P15382 129 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 TCF4P15884 667 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 ECHS1P30084 290 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 GPD2P43304 727 aa18.92■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 SERINC5Q86VE9 423 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 TTC39CQ8N584 583 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 KLHDC9Q8NEP7 349 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 STRIP2Q9ULQ0 834 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 PSTPIP1O43586 416 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 HMGCRP04035 888 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 CHRNA3P32297 505 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 PTGIRP43119 386 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 ACOT1Q86TX2 421 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 RSPH3Q86UC2 560 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 XYLT1Q86Y38 959 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 PLVAPQ9BX97 442 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 NEUROG2Q9H2A3 272 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 DPH5Q9H2P9 285 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 SYNCQ9H7C4 482 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-201ENST00000331789 SPTLC1O15269 473 aa18.91■□□□□ 0.62
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