RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 SP8Q8IXZ3 490 aa23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIT2Q99578 217 aa23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARMCX1Q9P291 453 aa23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC24A2Q9UI40 661 aa23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A1B0GVG6 124 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 GLRA2P23416 452 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARFIP2P53365 341 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 CACNA2D1P54289 1103 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCKAP1LP55160 1127 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 CENPUQ71F23 418 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF516Q92618 1163 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 DENND3A2RUS2 1198 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 GCNT1Q02742 428 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP24A1Q07973 514 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 EFHC2Q5JST6 749 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD22Q5VYY1 191 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP128Q6ZU80 1094 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM55Q9BYV6 548 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT82Q9NSB4 513 aa23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 AMPD1P23109 780 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 LMNB2Q03252 620 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 MORF4L2Q15014 288 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 MFSD14AQ96MC6 490 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAFAH2Q99487 392 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.354e-7■■■■□ 20.4
GRAMD1A-201ENST00000317991 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 NPTX2P47972 431 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF398Q8TD17 642 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSSK1BQ9BXA7 367 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 SGK1O00141 431 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT1P04264 644 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM182AQ5T1J6 154 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 LIN9Q5TKA1 542 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXO27Q8NI29 283 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM11Q96F44 468 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYNCQ9H7C4 482 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL20A1Q9P218 1284 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 TJP3O95049 919 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEK3P51956 506 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 BANPQ8N9N5 519 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 HIF1AQ16665 826 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 PYROXD1Q8WU10 500 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 MZB1Q8WU39 189 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 BSNDQ8WZ55 320 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 STMN2Q93045 179 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 SKA1Q96BD8 255 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 IDI2Q9BXS1 227 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM4Q9C037 500 aa23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1A-201ENST00000317991 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOMO3P69849 1222 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 XKR9Q5GH70 373 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 GATA6Q92908 595 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 F8VP50 259 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPS6KA3P51812 740 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 WNT7BP56706 349 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMC2Q8TDI7 906 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGD4Q96M96 766 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP2A1O14983 1001 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 LGR5O75473 907 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZCCHC18P0CG32 403 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 BGNP21810 368 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDK16Q00536 496 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 AP1B1Q10567 949 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADGRD1Q6QNK2 874 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM270Q6UE05 265 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 IWS1Q96ST2 819 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms