RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 EPHB4P54760 987 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 TAS2R40P59535 323 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 KCNA10Q16322 511 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 PRELID2Q8N945 189 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 HTTP42858 3142 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 M0QZ92 97 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 VDRP11473 427 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 TOMM70O94826 608 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 XKR4Q5GH76 650 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 CPXM1Q96SM3 734 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 M0QYV0 167 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 OGDHQ02218 1023 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 PAK2Q13177 524 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 CNGA2Q16280 664 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SGO2Q562F6 1265 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SERINC5Q86VE9 423 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SESTD1Q86VW0 696 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 C12orf29Q8N999 325 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 C3orf20Q8ND61 904 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SCN1AP35498 2009 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNA1P02708 482 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 FAM153BP0C7A2 387 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 HSPA6P17066 643 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SSR1P43307 286 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 FAM153CQ494X1 144 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 EMBQ6PCB8 327 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 UBA3Q8TBC4 463 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 C18orf8Q96DM3 657 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 NME7Q9Y5B8 376 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 PHF2O75151 1096 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 KCNE1P15382 129 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 CYP3A5P20815 502 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 RSPH3Q86UC2 560 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 BRCA2P51587 3418 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 H3BQF6 201 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 RPS6KA5O75582 802 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 HMGCRP04035 888 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 ERBB2P04626 1255 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 RARAP10276 462 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 MAN1A1P33908 653 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 GPD2P43304 727 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 DR1Q01658 176 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R5EQ16537 467 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 TTC39CQ8N584 583 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 CAVIN3Q969G5 261 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 GRIN2DO15399 1336 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 PIRO00625 290 aa24.08■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PSTPIP1O43586 416 aa24.08■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TRPA1O75762 1119 aa24.08■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TCF4P15884 667 aa24.08■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 OAS2P29728 719 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 GJC1P36383 396 aa24.08■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PLVAPQ9BX97 442 aa24.08■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.08■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 F8VP50 259 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 CD4P01730 458 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ECHS1P30084 290 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TTC27Q6P3X3 843 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 HERPUD2Q9BSE4 406 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 SYNCQ9H7C4 482 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms