RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.55■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ASMTLO95671 621 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 KCNJ2P63252 427 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 SP2Q02086 613 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 GPS1Q13098 491 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 OASLQ15646 514 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 RGS9BPQ6ZS82 235 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 BRSK2Q8IWQ3 736 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 NIPA2Q8N8Q9 360 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 GLIS1Q8NBF1 620 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 MCEEQ96PE7 176 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 STARD13Q9Y3M8 1113 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 TCF4P15884 667 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 FOXN2P32314 431 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 WDR4P57081 412 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 DCUN1D2Q6PH85 259 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ZPBP2Q6X784 338 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PCDH9Q9HC56 1237 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.54■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ALOX15BO15296 676 aa29.53■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 E2F5Q15329 346 aa29.53■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 STXBP2Q15833 593 aa29.53■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ASRGL1Q7L266 308 aa29.53■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 DENND1AQ8TEH3 1009 aa29.53■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 KLRG1Q96E93 195 aa29.53■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 RMDN2Q96LZ7 410 aa29.53■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 CCNB1P14635 433 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 SPARCL1Q14515 664 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 CENPUQ71F23 418 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 TRABDQ9H4I3 376 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 SLC24A2Q9UI40 661 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 FZD1Q9UP38 647 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 C19orf81C9J6K1 198 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ADCY3O60266 1144 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 PHACTR1Q9C0D0 580 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 LCTP09848 1927 aa29.52■■■□□ 2.32
UBP1-201ENST00000283628 F8VP50 259 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 EDN1P05305 212 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 CDKN2BP42772 138 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 HMGCS2P54868 508 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 ADCY1Q08828 1119 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 POLNQ7Z5Q5 900 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 PCGF5Q86SE9 256 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 SMC6Q96SB8 1091 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 MGAT5Q09328 741 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 ECHDC2Q86YB7 292 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 DNERQ8NFT8 737 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 FBF1Q8TES7 1133 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 NIF3L1Q9GZT8 377 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 PNMA3Q9UL41 463 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 PCDHGC3Q9UN70 934 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 EFR3BQ9Y2G0 817 aa29.51■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 OGDHQ02218 1023 aa29.5■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 CAPSQ13938 189 aa29.5■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 SBF1O95248 1867 aa29.5■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 CST3P01034 146 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 WDR72Q3MJ13 1102 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 VPS37BQ9H9H4 285 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 EBF2Q9HAK2 575 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 NRBP2Q9NSY0 501 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 FETUBQ9UGM5 382 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 CEP83Q9Y592 693 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 LRRD1A4D1F6 860 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 ETS1P14921 441 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 KRT15P19012 456 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 EFNA5P52803 228 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 SLC35B2Q8TB61 432 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D31Q96DN5 1066 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 CXorf56Q9H5V9 222 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 CISHQ9NSE2 258 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 STRIP2Q9ULQ0 834 aa29.49■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 BRD2P25440 801 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 SURF1Q15526 300 aa29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 PDK4Q16654 411 aa29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 GPAT2Q6NUI2 795 aa29.48■■■□□ 2.31
UBP1-201ENST00000283628 ERICH1Q86X53 443 aa29.48■■■□□ 2.31
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