RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000048077.11

Lime1-201, Transcript of Lck-interacting transmembrane adapter 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lime1, Length 1,959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lime1-201ENSMUST00000048077 Fbxo33Q8VE08 562 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Setd3Q91WC0 594 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 NcaldQ91X97 193 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Q9D2Q3 444 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 MlklQ9D2Y4 472 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Q9DA42 136 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 SisF8VQM5 1818 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Arid2E9Q7E2 1828 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Rabgap1A2AWA9 1064 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Lonrf2B2RT44 518 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Ccdc6D3YZP9 469 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Eno1P17182 434 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 LeprP48356 1162 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Lrch1P62046 709 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Arl14Q3SXC5 192 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Gprin1Q3UNH4 932 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Abhd15Q5F2F2 459 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Rab34Q64008 259 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Srd5a1Q68FF9 255 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Moxd2Q7TT41 619 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Q80ZQ3 298 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Fbxo44Q8BK26 255 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Qsox1Q8BND5 748 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Phka2Q8BWJ3 1235 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 OafQ8QZR4 282 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Epn3Q91W69 636 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Pcdhb1Q91Y08 818 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Cdk9Q99J95 372 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Mrps22Q9CXW2 359 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Nudt5Q9JKX6 218 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Clcn2Q9R0A1 908 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Pck1Q9Z2V4 622 aa14.65□□□□□ -0.06
Lime1-201ENSMUST00000048077 Gm3460E9QAI8 215 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Casp8O89110 480 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Ephb2P54763 986 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Atp11aP98197 1187 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Pou2f2Q00196 463 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Tfdp1Q08639 410 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 GsapQ3TCV3 858 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 TraddQ3U0V2 310 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Mylk3Q3UIZ8 795 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Ccdc110Q3V125 848 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 HarsQ61035 509 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Dzip3Q7TPV2 1204 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Gpr151Q7TSN6 422 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Agap1Q8BXK8 857 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Q8BZE1 841 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 OlahQ8R197 265 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Uroc1Q8VC12 676 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Fgfr1op2Q9CRA9 253 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Fut2Q9JL27 347 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Trpc2Q9R244 1172 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Atad5Q4QY64 1826 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Gm6583E9Q8Z1 469 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 F6Y6L6 278 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Fignl2J3QK54 644 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Anxa8O35640 327 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 E2f6O54917 272 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Ppargc1aO70343 797 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Ctnnal1O88327 731 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 FlgP11088 336 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Stmn1P54227 149 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 PhbP67778 272 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Lig3P97386 1015 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Znf112Q0VAW7 879 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Lrch2Q3UMG5 773 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 GmncQ3URY2 333 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Atg9bQ6EBV9 922 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Vmn2r43Q80Z08 845 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Sgk1Q9WVC6 431 aa14.64□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Vmn2r59E9PUT5 865 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Apol11aE9PZG0 334 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Trove2O08848 538 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Smyd1P97443 490 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Ripply1Q2WG77 201 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 LbpQ61805 481 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 PrcpQ7TMR0 491 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 N4bp3Q8C7U1 537 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Lamtor4Q8CF66 99 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Mcoln2Q8K595 566 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Fgd4Q91ZT5 766 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Setd6Q9CWY3 473 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Prss23Q9D6X6 382 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Znf654Q9DAU9 571 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Tmod4Q9JLH8 345 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Clec4aQ9QZ15 238 aa14.63□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Zfp94E9Q6Y4 486 aa14.62□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 IapP03975 557 aa14.62□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 EdnrbP48302 442 aa14.62□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Arl4cP61208 192 aa14.62□□□□□ -0.07
Lime1-201ENSMUST00000048077 Ifnl2Q4VK74 193 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.6 ms