RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcd1P48410 736 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Upf3bQ3ULL6 472 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grik1Q60934 836 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ltbp3Q61810 1268 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PostnQ62009 838 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DstykQ6XUX1 927 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prss50Q8BLH5 439 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Brat1Q8C3R1 822 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trmt10bQ9D075 318 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf6Q9DBU5 667 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Timp4Q9JHB3 224 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Frem3Q5H8B9 2123 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 KcpQ3U492 1550 aa24.25■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rap1gapA2ALS5 663 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1023A2ASU6 311 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm11758A2BEI6 360 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm11757A2BEI8 360 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcb5B5X0E4 1255 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 H2-T24F8VQG4 363 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RaxO35602 342 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mllt10O54826 1068 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aff1O88573 1216 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nub1P54729 614 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Uchl4P58321 233 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fgf13P70377 245 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdh8P97291 799 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MylpfP97457 169 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igbp1Q61249 340 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RbfaQ6P3B9 350 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cfap100Q80VN0 613 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcp10aQ80W76 438 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Robo4Q8C310 1012 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scyl2Q8CFE4 930 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kbtbd12Q9D618 625 aa24.24■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4932429P05RikA2ADI4 785 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm5624F6ZZG8 207 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnj2P35561 428 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Flt3lgP49772 232 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Oca2Q62052 833 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbm12b2Q66JV4 834 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Polr3gQ6NXY9 223 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bank1Q80VH0 783 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfml3Q8BK62 406 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rspry1Q8BVR6 576 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem63cQ8CBX0 802 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mfsd14bQ8CIA9 507 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taf12Q8VE65 161 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4846B2RWH8 538 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm5160F8VPN3 147 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hes2O54792 157 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prl2c3P04768 224 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gnat1P20612 350 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pdrg1P59048 133 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spire1Q52KF3 598 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klra6Q60653 266 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ksr1Q61097 873 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adam6bQ6IMH7 756 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc7a14Q8BXR1 771 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam161bQ8CB59 589 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo43Q8CDI2 640 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acsf2Q8VCW8 615 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mical1Q8VDP3 1048 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh3d19Q91X43 789 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TrabdQ99JY4 376 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Card14Q99KF0 999 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MlklQ9D2Y4 472 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbm31yQ9D3U4 565 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q9D454 513 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700123K08RikQ9D991 295 aa24.22■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wfdc11A2A5H7 82 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm5483B2RV77 97 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfand4D3Z3C6 739 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Alkbh1P0CB42 389 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nek1P51954 1203 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt80Q0VBK2 452 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prmt8Q6PAK3 394 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sval3Q76I99 144 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem169Q8BG50 297 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AdigQ8R400 80 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Yaf2Q99LW6 179 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Antxr1Q9CZ52 562 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DlstQ9D2G2 454 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ascl3Q9JJR7 174 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MgamB5THE2 1827 aa24.21■■□□□ 1.47
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa24.2■■□□□ 1.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rabgap1lA6H6A9 815 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.4 ms