RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeastyeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPQ1YPL179W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W PKP2P53170 491 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W YGR050CP53231 118 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W HCH1P53834 153 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W GPI15P53961 229 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W DYN2Q02647 92 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W YMR082CQ04276 118 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W FSH2Q05015 223 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W ARR2Q06597 130 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W MCH1Q07376 486 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W PAM18Q07914 168 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W RAX2Q12465 1220 aa3.09□□□□□ -1.91
PPQ1YPL179W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W VPS63O13549 108 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W URA5P13298 226 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W RPB9P27999 122 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W LSM12P38828 187 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W ORM1P53224 222 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W DID2P69771 204 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W BER1Q06688 274 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YOL029CQ08187 201 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W SOD1P00445 154 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W HTB1P02293 131 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W NOP1P15646 327 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W MIA40P36046 403 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W SLM6P38343 150 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YPL264CQ08980 353 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W ATX2Q12067 313 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W PRR2Q12310 699 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W ATP14Q12349 124 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W JID1Q12350 301 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W ISN1Q99312 450 aa3.08□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W MRS3P10566 314 aa3.07□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W BGL2P15703 313 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W LAC1P28496 418 aa3.07□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W WSS1P38838 269 aa3.07□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W COX15P40086 486 aa3.07□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W NDE2Q07500 545 aa3.07□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W IRC23Q08416 157 aa3.07□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W CCW14O13547 238 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W FCY2P17064 533 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W ELO2P25358 347 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W TCA17P32613 152 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W VMA7P39111 118 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YEA4P40004 342 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YGR269WP40326 108 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W LST8P41318 303 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W PDR17P53844 350 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YHP1Q04116 353 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W FRQ1Q06389 190 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YGL258W-AQ3E740 77 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W DYN1P36022 4092 aa3.06□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YPT31P38555 223 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W NSA2P40078 261 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YER188WP40103 239 aa3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W SWM2P40342 146 aa3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W SNX4P47057 423 aa3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YIP1P53039 248 aa3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W DCS1Q06151 350 aa3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W SRL1Q08673 210 aa3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W ATG31Q12421 196 aa3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa3.05□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YBR085C-AO43137 85 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W TOM40P23644 387 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W AHT1P29589 182 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YPS1P32329 569 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W UPS2P35200 230 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YCR041WP37265 110 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W FLO5P38894 1075 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W PSD1P39006 500 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YAR068WP39564 161 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W SYG1P40528 902 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W HXT14P42833 540 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W DUG3P53871 357 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YPS3Q12303 508 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W AGC1Q12482 902 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YMR316C-AI2HB70 103 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W PHO85P17157 305 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W CDC50P25656 391 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W RAD23P32628 398 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W ECM31P38122 312 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W QDR3P38227 689 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W EMC5P40540 141 aa3.04□□□□□ -1.92
PPQ1YPL179W YJR015WP47090 510 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.1 ms