RNA–Protein interactions for RNA: YMR253C

YMR253C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR253C, Length 1,245 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR253CYMR253C YDR286CQ05530 114 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C XYL2Q07993 356 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C HRT1Q08273 121 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C YPL264CQ08980 353 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C ATP10P18496 279 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C ERV1P27882 189 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C SRP21P32342 167 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C HOG1P32485 435 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C RAD23P32628 398 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C CMC1P36064 111 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C SPG5P42933 373 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C YNL092WP53934 400 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C RIM9Q04734 239 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C ALG6Q12001 544 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C RKI1Q12189 258 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C SMT3Q12306 101 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C OPI3P05375 206 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C HYP2P23301 157 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C SRP14P38985 146 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C CYB5P40312 120 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C CRH1P53301 507 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C MPP6P53725 186 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C MRPL1Q04599 285 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C THI72Q08579 599 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C PRM3Q08931 133 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C PFA4Q12006 378 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data6.4□□□□□ -1.38not detected
YMR253CYMR253C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C YIR021W-AQ3E739 70 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR253CYMR253C SOD1P00445 154 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C CPR2P23285 205 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C HMX1P32339 317 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C NTC20P38302 140 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C OM14P38325 134 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C ANS1P38832 159 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C LPP1Q04396 274 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C ATG33Q06485 197 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C MCP1Q12106 302 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C STE18P18852 110 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C ARF2P19146 181 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C ZRT1P32804 376 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C ELO1P39540 310 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YGR269WP40326 108 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YJL163CP46996 555 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YGL118CP53132 145 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C DYN2Q02647 92 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C PET191Q02772 108 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C ROT1Q03691 256 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C IRC13Q08630 104 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C RPL12BP0CX54 165 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C PAM17P36147 197 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C FRM2P37261 193 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C COX15P40086 486 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C BNA1P47096 177 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YNR061CP53747 219 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C EOS1P53938 366 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YOL029CQ08187 201 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C LDS2Q08218 356 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C TGS1Q12052 315 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C GEP5Q12393 293 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YOS1Q3E834 85 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C SCS22Q6Q595 175 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YLR365WQ7LIF2 110 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C HMRA1P0CY11 126 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YOX1P34161 385 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YBL059WP34224 193 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YAL037WP39728 267 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YFL054CP43549 646 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YPL039WQ03080 316 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C FCY2P17064 533 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C REC104P33323 182 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C DFG10P40526 253 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C COQ5P49017 307 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C CPD1P53314 239 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C VPS71Q03433 280 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C BET5Q03630 159 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YLR296WQ05898 108 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C SWT1Q12104 458 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C INO4P13902 151 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C COX10P21592 462 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C SRB5P32585 307 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C REC114P32841 428 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YAR068WP39564 161 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C LCL3P53153 274 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C CUZ1P53899 274 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C PAM18Q07914 168 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR253CYMR253C YLL053CP0CD98 152 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR253CYMR253C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
YMR253CYMR253C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
YMR253CYMR253C RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
YMR253CYMR253C RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
YMR253CYMR253C QRI5P32344 111 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR253CYMR253C YHR130CP38834 111 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR253CYMR253C ECM14P38836 430 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.3 ms