RNA–Protein interactions for RNA: YML036W

CGI121, Transcript of Component of the EKC/KEOPS complex, yeast

Gene CGI121, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CGI121	YML036W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	MSB2	P32334	1306 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	MDM35	O60200	86 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	RFC2	P40348	353 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	YNL140C	P53910	189 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	DAD4	P69851	72 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	COX8	P04039	78 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	STP22	P25604	385 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	FLX1	P40464	311 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	SBH1	P52870	82 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	UBC7	Q02159	165 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	RCE1	Q03530	315 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	FYV12	Q08559	129 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	FIT2	Q08906	153 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	ATP20	Q12233	115 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CGI121	YML036W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	SFK1	P35735	353 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	RRT1	P38192	103 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	TTI2	P47168	421 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	SOL1	P50278	321 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	PLP1	Q04004	230 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	GAL83	Q04739	417 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	DAS2	Q12084	232 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	HSP30	P25619	332 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	HPA3	P39979	161 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YER121W	P40076	114 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	HSK3	P69852	69 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	VPS28	Q02767	242 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	CWC27	Q02770	301 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	PIR1	Q03178	341 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YPR127W	Q06494	345 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YOR214C	Q12282	236 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YCR023C	P25351	611 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	NUF2	P33895	451 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	RPB7	P34087	171 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	CPR5	P35176	225 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YHL042W	P38729	150 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YFH7	P43591	353 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	XPT1	P47165	209 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	TIM13	P53299	105 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	GRX5	Q02784	150 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	UPS3	Q04006	179 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	UPS1	Q05776	175 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	QCR2	P07257	368 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	STF2	P16965	84 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	FES1	P38260	290 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	CSH1	P38287	376 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	NSE4	P43124	402 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YFL065C	P43539	102 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	DML1	Q03652	475 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	THI74	Q04083	370 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YMR252C	Q04814	134 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	TRM3	Q07527	1436 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	RAD6	P06104	172 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	AQY2	P0CD90	149 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YCL042W	P25572	119 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YEL008W	P40001	126 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	SOK1	P40317	901 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	MPM1	P40364	252 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YHP1	Q04116	353 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	RIM9	Q04734	239 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YLR053C	Q12026	108 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	ATG41	Q12048	136 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	RDI1	Q12434	202 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	VAR1	P02381	398 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	SEN2	P16658	377 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YBL010C	P32788	280 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YEL028W	P39989	153 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YGL235W	P53071	178 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	MAK3	Q03503	176 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	SYM1	Q06563	197 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	MAK31	P23059	88 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	PTC1	P35182	281 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CGI121	YML036W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.84	□□□□□ -2.27	not detected

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