RNA–Protein interactions for RNA: YER171W

RAD3, Transcript of 5' to 3' DNA helicase, yeast

Gene RAD3, Length 2,337 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD3	YER171W	LSB5	P25369	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YOX1	P34161	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	MRPS9	P38120	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	TRS20	P38334	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RMD6	P39975	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YER085C	P40058	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	GON7	P46984	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	MGA1	P53050	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YGL114W	P53134	725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	HCH1	P53834	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RSM10	Q03201	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	LIP2	Q06005	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RFM1	Q12192	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	CMC1	P36064	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YMR262W	P38430	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	GET2	P40056	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	CGR1	P53188	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	ARL3	Q02804	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	AVO2	Q04749	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	ARR3	Q06598	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	QCR9	P22289	66 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	COQ3	P27680	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	QDR3	P38227	689 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	GEP3	Q08622	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YBL059W	P34224	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	COX15	P40086	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	ALG14	P38242	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	DYN2	Q02647	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	LPP1	Q04396	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RAD3	YER171W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YMR31	P19955	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	CPR5	P35176	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	SSS1	P35179	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	DFG10	P40526	253 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	GAT3	Q07928	141 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	POM34	Q12445	299 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	MRPL28	P36527	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	PTC7	P38797	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YFL051C	P43552	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	HIT1	P46973	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	CRH1	P53301	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	ATC1	Q04005	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	MRS3	P10566	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	DER1	P38307	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	HSP10	P38910	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	ATG27	P46989	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YJR015W	P47090	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	LST7	P53237	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	DAD3	P69850	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YPS3	Q12303	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	LAS17	Q12446	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	RPL39	P04650	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	PAU3	P25610	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	PAU5	P43575	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	PIR5	P46999	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	CRZ1	P53968	678 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	API2	Q04413	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YOP1	Q12402	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YBR220C	P38318	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	YFL015C	P43578	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	BOR1	P53838	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD3	YER171W	SEN15	Q04675	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 107 ms