RNA–Protein interactions for RNA: YCR098C

GIT1, Transcript of Plasma membrane permease, yeast

Gene GIT1, Length 1,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GIT1	YCR098C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	NDE2	Q07500	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	GAT3	Q07928	141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	ATG40	Q99325	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	SIM1	P40472	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YJR012C	P47087	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	UPS1	Q05776	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	COA2	Q3E823	68 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	TEL1	P38110	2787 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YOX1	P34161	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	ERV15	P38312	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	GON7	P46984	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	MCM22	P47167	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	ATP23	P53722	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	SUR7	P54003	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YML108W	Q03759	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	CSM4	Q08955	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	CNB1	P25296	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	TIR2	P33890	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	HOT13	P36078	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YHL037C	P38733	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	RMD6	P39975	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	PRM5	P40476	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	HCH1	P53834	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YMR082C	Q04276	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	RIM9	Q04734	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	FCY22	Q12119	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	ATG5	Q12380	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	CUE1	P38428	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	MST28	P39552	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	COX15	P40086	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	EMC5	P40540	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	XPT1	P47165	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	GIM5	Q04493	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YCR025C	P25352	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	SRB6	P32570	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YBR220C	P38318	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YEA4	P40004	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YIA6	P40556	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YGL262W	P53054	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	CPD1	P53314	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	APJ1	P53940	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	CRZ1	P53968	678 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	HSK3	P69852	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	GMC1	Q04399	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GIT1	YCR098C	RPL39	P04650	51 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	LDS1	P31379	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	IES6	P32617	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SLM6	P38343	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SUR2	P38992	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SLM1	P40485	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YIL024C	P40543	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YJR056C	P47115	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SED1	Q01589	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	RFM1	Q12192	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	COX19	Q3E731	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YCH1	P42937	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	WSC2	P53832	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	ADD37	Q03233	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	POM33	Q12164	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	DGK1	Q12382	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	ROX3	P25046	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	ECM31	P38122	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	FLO5	P38894	1075 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	DFG10	P40526	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	GEP7	P53171	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	SNO1	Q03144	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	PRR2	Q12310	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GIT1	YCR098C	MIC12	P38341	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.6 ms