RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TFAP2BQ92481 460 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNG4Q9UBN1 327 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 TACC1O75410 805 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 BRD2P25440 801 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 TUSC3Q13454 348 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 ACAD10Q6JQN1 1059 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35F6Q8N357 371 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGC3Q9UN70 934 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CASTOR2A6NHX0 329 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 DPH6Q7L8W6 267 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CYFIP2Q96F07 1278 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 NT5C1AQ9BXI3 368 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PDCL3Q9H2J4 239 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 MOCS3O95396 460 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 FGFR1P11362 822 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 RFC2P35250 354 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ORC1Q13415 861 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 NOMO2Q5JPE7 1267 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC93AQ86WB7 457 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 TOP6BLQ8N6T0 577 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf58Q8NDZ4 430 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 APPL2Q8NEU8 664 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 UROC1Q96N76 676 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PAAF1Q9BRP4 392 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 THAP2Q9H0W7 228 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 L1RE1Q9UN81 338 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 NME7Q9Y5B8 376 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 NCANO14594 1321 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 HUS1O60921 280 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM163BP0C2L3 166 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CD19P15391 556 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCB4P21439 1286 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CASQ1P31415 396 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 NOMO3P69849 1222 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPCQ03188 943 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB128Q7Z7B8 93 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 VWCEQ96DN2 955 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 NOX5Q96PH1 765 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1257Q9ULG3 409 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 MED7O43513 233 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 BUB1O43683 1085 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 VDRP11473 427 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM58Q8NG06 486 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 URGCPQ8TCY9 931 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM170AA1A519 330 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CYB561D2O14569 222 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0355O15063 1070 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 NAA35Q5VZE5 725 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PASD1Q8IV76 773 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6B3Q8NGW1 331 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CPA5Q8WXQ8 436 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF26Q96DR7 871 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 LSM8O95777 96 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMP1P01033 207 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 WARSP23381 471 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PAX3P23760 479 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 GPC5P78333 572 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 DSC1Q08554 894 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEAL1Q15170 157 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 RFFLQ8WZ73 363 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 RABGGTAQ92696 567 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SENP8Q96LD8 212 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC3P53804 2025 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM43BA6NCK2 446 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 NSFP46459 744 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SGO2Q562F6 1265 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CD300LGQ6UXG3 332 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRF2Q8IZF7 708 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 LHX5Q9H2C1 402 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 DDHD2O94830 711 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGB8P26012 769 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CNGA2Q16280 664 aa26.45■■□□□ 1.83
CAPNS1-215ENST00000628018 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa26.45■■□□□ 1.83
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