RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPB1P15086 417 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 OSTM1Q86WC4 334 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD207Q9UJ71 328 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 C5orf42Q9H799 3197 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 C1RP00736 705 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNQ1P51787 676 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDR1P51861 262 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPH6Q7L8W6 267 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEMA4DQ92854 862 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 HCRTO43612 131 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABLIM3O94929 683 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFKBIBQ15653 356 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 THAP9Q9H5L6 903 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-208ENST00000566515 GABRDO14764 452 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 RFPL2O75678 378 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 FMO5P49326 533 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAF4BQ92750 862 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 S1PR5Q9H228 398 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB20Q9NX57 234 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPP7Q9UHL4 492 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDH22Q9UJ99 828 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYCE3A1L190 88 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAP1GAPP47736 663 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 LHX1P48742 406 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDH8P55286 799 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADCY1Q08828 1119 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNH2Q12809 1159 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 AAK1Q2M2I8 961 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEC24AO95486 1093 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 WEE2P0C1S8 567 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATF2P15336 505 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMO2P25791 158 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYL7Q01449 175 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR17Q13304 367 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 LIN9Q5TKA1 542 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 TPGS2Q68CL5 300 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA18Q8TC71 538 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASB2Q96Q27 587 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SDCBP2Q9H190 292 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 MBTPS2O43462 519 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 TACC1O75410 805 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 VNN2O95498 520 aa22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms