RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565379.1

NME3-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, human

TSL 2

Gene NME3, Length 911 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NME3-208	ENST00000565379	SOD2	P04179	222 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	FMO5	P49326	533 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	FUT10	Q6P4F1	479 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	POMK	Q9H5K3	350 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	HPDL	Q96IR7	371 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	PIK3CA	P42336	1068 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	MYL7	Q01449	175 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	VWA3B	Q502W6	1294 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	LUZP1	Q86V48	1076 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	GPR65	Q8IYL9	337 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	HASPIN	Q8TF76	798 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	SUSD3	Q96L08	255 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	KPNA7	A9QM74	516 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379		M0QZQ0	153 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	PPEF2	O14830	753 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	SYN3	O14994	580 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	HLA-DRA	P01903	254 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	UROD	P06132	367 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	KLRC2	P26717	231 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	CLCN4	P51793	760 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	USP41	Q3LFD5	358 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	CBWD6	Q4V339	395 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	NDST4	Q9H3R1	872 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	RAB20	Q9NX57	234 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NME3-208	ENST00000565379	PLXNA3	P51805	1871 aa		27.83	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	TEX28	O15482	410 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	VNN1	O95497	513 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	MYL6	P60660	151 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	KRT31	Q15323	416 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	PDXDC1	Q6P996	788 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	APPL2	Q8NEU8	664 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	FAM84A	Q96KN4	292 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	DSE	Q9UL01	958 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	FAM163B	P0C2L3	166 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	P4HA1	P13674	534 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	GLUD2	P49448	558 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	ZNF699	Q32M78	642 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	WDR44	Q5JSH3	913 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	DPH6	Q7L8W6	267 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	SPATA18	Q8TC71	538 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	ODC1	P11926	461 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	TYMP	P19971	482 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	BRCC3	P46736	316 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	MIIP	Q5JXC2	388 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	CES5A	Q6NT32	575 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	SENP8	Q96LD8	212 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	CHST7	Q9NS84	486 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	SPTLC1	O15269	473 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	FGFR3	P22607	806 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	TNNC1	P63316	161 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	ZXDA	P98168	799 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	DSG1	Q02413	1049 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	NHLH1	Q02575	133 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	ITIH3	Q06033	890 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NME3-208	ENST00000565379	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		27.79	■■■□□ 2.04

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