RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 PLK5Q496M5 336 aa21.51■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.51■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 ITIH5Q86UX2 942 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.49■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 GUCY1B3Q02153 619 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 ST3GAL1Q11201 340 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 KCNK18Q7Z418 384 aa21.47■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF12Q96FN5 646 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-214ENST00000560163 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.46■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 EBF3Q9H4W6 596 aa21.46■■□□□ 1.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 C4orf47A7E2U8 309 aa21.45■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 FAM189A1O60320 539 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 GALK1P51570 392 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 SENP8Q96LD8 212 aa21.45■■□□□ 1.02
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