RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 TRIM29Q14134 588 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 GRM4Q14833 912 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 SLFN13Q68D06 897 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 SHC4Q6S5L8 630 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 RNF180Q86T96 592 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 DTX3Q8N9I9 347 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 VPS11Q9H270 941 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 DEF6Q9H4E7 631 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 KAT14Q9H8E8 782 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 HPSEQ9Y251 543 aa6.16□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 CBX4O00257 560 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 TRAF5O00463 557 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 CUTAO60888 179 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 ZNF202O95125 648 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 ADCY5O95622 1261 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 AMHP03971 560 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 TSPY3P0CV98 308 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 TSPY8P0CW00 308 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 PFKFB1P16118 471 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 SOX5P35711 763 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 SELENOPP49908 381 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 HMGA2P52926 109 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 IQCB1Q15051 598 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 HS1BP3Q53T59 392 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 DACT2Q5SW24 774 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 RESP18Q5W5W9 173 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 CD244Q9BZW8 370 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 TMX1Q9H3N1 280 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 CABP5Q9NP86 173 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 DLL4Q9NR61 685 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TRDN-205ENST00000546248 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 A0A087WWV3 80 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CYTH3O43739 400 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ECE2O60344 883 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 MAFKO60675 156 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 LTFP02788 710 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 AKR1B1P15121 316 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 KCNA3P22001 575 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 KRT2P35908 639 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 VASNQ6EMK4 673 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 LUZP1Q86V48 1076 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 NXPE1Q8N323 547 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CHST14Q8NCH0 376 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 Q8TCH9 128 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 TIGD1Q96MW7 591 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 USP25Q9UHP3 1055 aa6.14□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
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