RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508350.1

CDH18-208, Transcript of cadherin 18, human

TSL 4

Gene CDH18, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDH18-208	ENST00000508350	EPCAM	P16422	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CYP3A5	P20815	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	FGFR3	P22607	806 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KLRC2	P26717	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	OR1D2	P34982	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	GLUD2	P49448	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ARPP19	P56211	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	LILRA4	P59901	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RBP5	P82980	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TFF2	Q03403	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	UBE3A	Q05086	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TYRO3	Q06418	890 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	BIRC3	Q13489	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NR6A1	Q15406	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NFIL3	Q16649	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	DUSP6	Q16828	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SV2A	Q7L0J3	742 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CD302	Q8IX05	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	UROC1	Q96N76	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TLE6	Q9H808	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	COL6A3	P12111	3177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TRANK1	O15050	2925 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350		M0QZQ0	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ATP9B	O43861	1147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PHACTR2	O75167	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ATP2C2	O75185	946 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TBX10	O75333	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SOAT2	O75908	522 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	VNN2	O95498	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	UROD	P06132	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KRT13	P13646	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KCNA5	P22460	613 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	LTBR	P36941	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TAF6	P49848	677 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CDH8	P55286	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CLDN10	P78369	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	APBA1	Q02410	837 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	DSG1	Q02413	1049 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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