RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARL5CA6NH57 179 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 KPNA7A9QM74 516 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTGESO14684 152 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 MOCS3O95396 460 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTSHP09668 335 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAF6P49848 677 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 ITIH3Q06033 890 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 SV2CQ496J9 727 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 PALB2Q86YC2 1186 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 MCOLN2Q8IZK6 566 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF333Q96JL9 665 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM84AQ96KN4 292 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 UROC1Q96N76 676 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADAM2Q99965 735 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 CARD6Q9BX69 1037 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAS2R14Q9NYV8 317 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNX12Q9UMY4 172 aa9.85□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 C9IYK1 514 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 THAP12O43422 761 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 MGEA5O60502 916 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 PALMO75781 387 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 GHRP10912 638 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 MMP8P22894 467 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 NSFP46459 744 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 LILRA4P59901 499 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 NOMO3P69849 1222 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 MTFR1Q15390 333 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAF3Q5VWG9 929 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 STK32AQ8WU08 396 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 GOLGA1Q92805 767 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 TLR10Q9BXR5 811 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 MIS12Q9H081 205 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 THAP2Q9H0W7 228 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACP6Q9NPH0 428 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEP83Q9Y592 693 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.84□□□□□ -0.83
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCNTO95613 3336 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 HTTP42858 3142 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 BUB1O43683 1085 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 CXCL10P02778 98 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 CALB1P05937 261 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 GABRB2P47870 512 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDH8P55286 799 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNX16P57768 344 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAP1Q03518 808 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTP4A2Q12974 167 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 MBTPS1Q14703 1052 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLUL1Q15846 466 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 LIN9Q5TKA1 542 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 MON1BQ7L1V2 547 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 PBKQ96KB5 322 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 MMS19Q96T76 1030 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 SDCBP2Q9H190 292 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 RSAD1Q9HA92 442 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDR35Q9P2L0 1181 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 POLIQ9UNA4 740 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.83□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.82□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms