RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379565.7

RPS6KA3-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA3, Length 7,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-201ENST00000379565 CYTH3O43739 400 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 UGP2Q16851 508 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 JCADQ9P266 1359 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 FBXO32Q969P5 355 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIF2CQ99661 725 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM107AO95990 144 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 NCKAP1LP55160 1127 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 PPP2R2AP63151 447 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 CYTH1Q15438 398 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 RD3Q7Z3Z2 195 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 APEX2Q9UBZ4 518 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS6KA3-201ENST00000379565 AKAP10O43572 662 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 PMPCBO75439 489 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 PCDH8O95206 1070 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 MYL4P12829 197 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 HPGDP15428 266 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 CUL4AQ13619 759 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMC7Q7Z402 723 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 ARRDC4Q8NCT1 418 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF438Q7Z4V0 828 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 ATL2Q8NHH9 583 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 DDI1Q8WTU0 396 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 STARD7Q9NQZ5 370 aa18.27■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 STX7O15400 261 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 VCLP18206 1134 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHST13Q8NET6 341 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 OPTNQ96CV9 577 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 AMACRQ9UHK6 382 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 PDXKO00764 312 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 PTPN7P35236 360 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM60Q495X7 471 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 F5H5T6 163 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 POU4F1Q01851 419 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TTC26A0AVF1 554 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 WDCPQ9H6R7 721 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 CRB1P82279 1406 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 PDK1Q15118 436 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM151AQ8WW52 585 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 F8W810 466 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 GPAT2Q6NUI2 795 aa18.26■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 BFSP2Q13515 415 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 VN1R5Q7Z5H4 357 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 CPA4Q9UI42 421 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM187AA6NFU0 413 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 BTNL9Q6UXG8 535 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 CALML6Q8TD86 181 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 HLA-DRAP01903 254 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 CKBP12277 381 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 EFHC1Q5JVL4 640 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC3Q9BQI4 270 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 DPP3Q9NY33 737 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 P4HA2O15460 535 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM16O95361 564 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 GPD1P21695 349 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 EPHB2P29323 1055 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 GTF2H1P32780 548 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 CYGBQ8WWM9 190 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TADA1Q96BN2 335 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 APPL1Q9UKG1 709 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 ENTPD3O75355 529 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 GPC1P35052 558 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 AVPR1AP37288 418 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 SPATA18Q8TC71 538 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANKRD49Q8WVL7 239 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRABDQ9H4I3 376 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TEX33O43247 280 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 RASSF9O75901 435 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 ORC1Q13415 861 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 VPS37AQ8NEZ2 397 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.25■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 NEK2P51955 445 aa18.24■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 SEZ6Q53EL9 994 aa18.24■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 NDEL1Q9GZM8 345 aa18.24■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF229Q9UJW7 825 aa18.24■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 SYNMO15061 1565 aa18.24■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 NCAPD2Q15021 1401 aa18.24■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM65Q6PJ69 517 aa18.24■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHMP2BQ9UQN3 213 aa18.24■□□□□ 0.51
RPS6KA3-201ENST00000379565 GRID2IPA4D2P6 1211 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms