RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 AVPR1AP37288 418 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CXCL9Q07325 125 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 SNX31Q8N9S9 440 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 FAM136AQ96C01 138 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 THAP2Q9H0W7 228 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 PKP3Q9Y446 797 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 M0QYT0 321 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 GYPCP04921 128 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 PCSK1P29120 753 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CCZ1BP86790 482 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 GPRASP2Q96D09 838 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 NPHS2Q9NP85 383 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CD274Q9NZQ7 290 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 UVRAGQ9P2Y5 699 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 PXDNLA1KZ92 1463 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CASTOR2A6NHX0 329 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 SKIP12755 728 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 TROAPQ12815 778 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 SYCE1LA8MT33 242 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 NAB2Q15742 525 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CAPN10Q9HC96 672 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 HIST1H2ADP20671 130 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 WEE1P30291 646 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 STILQ15468 1287 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 HIST1H2AJQ99878 128 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CBWD1Q9BRT8 395 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 H2AFJQ9BTM1 129 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ARHGAP10A1A4S6 786 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 WDR48Q8TAF3 677 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 GPR63Q9BZJ6 419 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ETNK1Q9HBU6 452 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF212Q9UDV6 495 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 RAD51CO43502 376 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 PMPCBO75439 489 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 AP1G2O75843 785 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ARL4DP49703 201 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 DMTNQ08495 405 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 LRRC74AQ0VAA2 488 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ZDHHC15Q96MV8 337 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 OSBPL8Q9BZF1 889 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ODC1P11926 461 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CYP11B2P19099 503 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CDH18Q13634 790 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 OSMRQ99650 979 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 DDIT4Q9NX09 232 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 EPHB2P29323 1055 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CUL2Q13617 745 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 SETD4Q9NVD3 440 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF197O14709 1029 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 KLRC1P26715 233 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 C11orf74Q86VG3 221 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 TC2NQ8N9U0 490 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 PXMP2Q9NR77 195 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 RNF19AQ9NV58 838 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM150BA6NC51 233 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 FAM47DPA6NHR8 397 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF263O14978 683 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 MAP3K7CLP57077 242 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 KAZALD1Q96I82 304 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 RUBCNLQ9H714 662 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ANKEF1Q9NU02 776 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 SPTLC1O15269 473 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 CYP2C19P33261 490 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-207ENST00000368226 ITGA8P53708 1063 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms