RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 TNIP3Q96KP6 325 aa12.99□□□□□ -0.33
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PTPRK-201ENST00000368202 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRK-201ENST00000368202 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.332e-6■□□□□ 8.4
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PTPRK-201ENST00000368202 PAAF1Q9BRP4 392 aa12.99□□□□□ -0.33
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PTPRK-201ENST00000368202 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PTPRK-201ENST00000368202 HESX1Q9UBX0 185 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRK-201ENST00000368202 NAGPAQ9UK23 515 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRK-201ENST00000368202 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PTPRK-201ENST00000368202 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRK-201ENST00000368202 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa12.96□□□□□ -0.33
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