RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 ORC1Q13415 861 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 F8W8V4 182 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 RRM1P23921 792 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 DSG3P32926 999 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SEC24CP53992 1094 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 FGD4Q96M96 766 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SRLQ86TD4 932 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 USP33Q8TEY7 942 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SMAPO00193 183 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 VWA5AO00534 786 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 CCDC22O60826 627 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SLC35C1Q96A29 364 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 TAF6P49848 677 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 FAM161BQ96MY7 647 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 WWP1Q9H0M0 922 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 HUNKP57058 714 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 PCSK1P29120 753 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SLC12A3P55017 1021 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 PTK7Q13308 1070 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 RAET1EQ8TD07 263 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 MROH8Q9H579 483 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 STOML1Q9UBI4 398 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 BOLA3Q53S33 107 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 GNASQ5JWF2 1037 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 BMP6P22004 513 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 PPIL6Q8IXY8 311 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 AGR3Q8TD06 166 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SMIM24O75264 130 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 TADA2AO75478 443 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 EVX2Q03828 476 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 KLK14Q9P0G3 267 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 KRT80Q6KB66 452 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 MKL1Q969V6 931 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 RMDN1Q96DB5 314 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 MTFR1LQ9H019 292 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-201ENST00000345716 ZBTB39O15060 712 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 SPAG6O75602 509 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 PDK1Q15118 436 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 METTL7BQ6UX53 244 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 ELMOD1Q8N336 334 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 CERS5Q8N5B7 392 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 E5RI56 91 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 PNPLA4P41247 253 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 DNERQ8NFT8 737 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 ZBTB18Q99592 522 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 CPT1AP50416 773 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 SERPINB9P50453 376 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 MORF4L2Q15014 288 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 CCDC78A2IDD5 438 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 AP3B1O00203 1094 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 GRIN3BO60391 1043 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 ATRNO75882 1429 aa21.69■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 TMEM150BA6NC51 233 aa21.69■■□□□ 1.06
NISCH-201ENST00000345716 VEPH1Q14D04 833 aa21.69■■□□□ 1.06
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