RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
MMP3-201ENST00000299855 NOD2Q9HC29 1040 aa9.65□□□□□ -0.86
MMP3-201ENST00000299855 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.65□□□□□ -0.86
MMP3-201ENST00000299855 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.65□□□□□ -0.86
MMP3-201ENST00000299855 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
MMP3-201ENST00000299855 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
MMP3-201ENST00000299855 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.65□□□□□ -0.86
MMP3-201ENST00000299855 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
MMP3-201ENST00000299855 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 M0R2N6 131 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 WNT7AO00755 349 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ASAP2O43150 1006 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 DDAH1O94760 285 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 FBXO21O94952 628 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 PDE8BO95263 885 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 A1BGP04217 495 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 VIMP08670 466 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CALML3P27482 149 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 NOS3P29474 1203 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CXCR5P32302 372 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 HSD17B3P37058 310 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 TKTL1P51854 596 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 BLVRAP53004 296 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 GTF2H3Q13889 308 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 NAB2Q15742 525 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ESX1Q8N693 406 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ANKS4BQ8N8V4 417 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 RAPGEF5Q92565 580 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 PBKQ96KB5 322 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 LRGUKQ96M69 825 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CCDC138Q96M89 665 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 RNF39Q9H2S5 420 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.65□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 RIPK2O43353 540 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 RFPL3O75679 317 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 SLITRK3O94933 977 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 PRKAR1BP31321 381 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 SOX6P35712 828 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 IFNAR2P48551 515 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 NR2C2P49116 596 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 TPGS2Q68CL5 300 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 SCFD2Q8WU76 684 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 SHDQ96IW2 340 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 SAMD11Q96NU1 681 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 NDST4Q9H3R1 872 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 VPS45Q9NRW7 570 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.64□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CCDC188H7C350 402 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 OPN1MWP04001 364 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ASGR2P07307 311 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 DRD4P21917 467 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 KLK7P49862 253 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CCT8P50990 548 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 DCAF7P61962 342 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ZNF844Q08AG5 666 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 LAMB3Q13751 1172 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 STAT4Q14765 748 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 NAA25Q14CX7 972 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 MAN2A1Q16706 1144 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 BBS9Q3SYG4 887 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 ERMARDQ5T6L9 678 aa9.63□□□□□ -0.87
MMP3-201ENST00000299855 CENPPQ6IPU0 288 aa9.63□□□□□ -0.87
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