RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 TFDP1Q14186 410 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CNGA3Q16281 694 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 OLFML1Q6UWY5 402 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 AZIN2Q96A70 460 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 HAPLN3Q96S86 360 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SENP1Q9P0U3 644 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 NDC80O14777 642 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 RARBP10826 455 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ODR4Q5SWX8 454 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PAOXQ6QHF9 649 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 KCTD1Q719H9 257 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CENPUQ71F23 418 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DHDDSQ86SQ9 333 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CASZ1Q86V15 1759 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 UQCRBP14927 111 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SNAP25P60880 206 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TLE6Q9H808 572 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 C10orf88Q9H8K7 445 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 AK5Q9Y6K8 562 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PDLIM1O00151 329 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 NELFEP18615 380 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 HOXD13P35453 343 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 FOLH1Q04609 750 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 NADK2Q4G0N4 442 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM50Q86XT4 487 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 MECRQ9BV79 373 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 KANSL3Q9P2N6 904 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DTNAQ9Y4J8 743 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 STRCP1A6NGW2 1772 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP10A1A4S6 786 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 MAGEB2O15479 319 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SORBS3O60504 671 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 FGRP09769 529 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 RAG1P15918 1043 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CDK8P49336 464 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 AQP5P55064 265 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 RHBDF2Q6PJF5 856 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 LZICQ8WZA0 190 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 HSFX1Q9UBD0 423 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 MUTP22033 750 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 NAA20P61599 178 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 BFSP1Q12934 665 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 KRT81Q14533 505 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 USH1GQ495M9 461 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ANO5Q75V66 913 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TREML1Q86YW5 311 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PASD1Q8IV76 773 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 OGFOD1Q8N543 542 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ABHD8Q96I13 439 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PAFAH2Q99487 392 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 XPOTO43592 962 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PEX1O43933 1283 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 INHBAP08476 426 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TFPTP0C1Z6 253 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CA8P35219 290 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PHBP35232 272 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms