RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V1G2O95670 118 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ARFIP2P53365 341 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TRIM50Q86XT4 487 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 HSPH1Q92598 858 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ELF1P32519 619 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 DSG3P32926 999 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 RNF43Q68DV7 783 aa9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TEX9Q8N6V9 391 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 HELQQ8TDG4 1101 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 KAT5Q92993 513 aa9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 NENFQ9UMX5 172 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 STOML1Q9UBI4 398 aa9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 PEX5P50542 639 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GRM1Q13255 1194 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 M0QYV0 167 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 EDIL3O43854 480 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TCEA3O75764 348 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MARCKSL1P49006 195 aa9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 AKT1S1Q96B36 256 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CD248Q9HCU0 757 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PAK5Q9P286 719 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TISP43B9A030 160 aa9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CFAP36Q96G28 342 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CHST7Q9NS84 486 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 LGALS13Q9UHV8 139 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 APOL1O14791 398 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SKIP12755 728 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ARL4AP40617 200 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 MTFR1Q15390 333 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-201ENST00000264345 CASC4Q6P4E1 433 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MID2Q9UJV3 735 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TAF1P21675 1872 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TOM1L1O75674 476 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 HSPA1LP34931 641 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZACNQ401N2 412 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZNF394Q53GI3 561 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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