RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
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RABGGTA-201ENST00000216840 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
RABGGTA-201ENST00000216840 ACBD3Q9H3P7 528 aa18.3■□□□□ 0.52
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RABGGTA-201ENST00000216840 FAM153AQ9UHL3 310 aa18.29■□□□□ 0.52
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RABGGTA-201ENST00000216840 PHF2O75151 1096 aa18.28■□□□□ 0.52
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RABGGTA-201ENST00000216840 INCA1Q0VD86 236 aa18.28■□□□□ 0.52
RABGGTA-201ENST00000216840 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa18.28■□□□□ 0.52
RABGGTA-201ENST00000216840 MFSD14CQ5VZR4 134 aa18.28■□□□□ 0.52
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RABGGTA-201ENST00000216840 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
RABGGTA-201ENST00000216840 CYTH4Q9UIA0 394 aa18.28■□□□□ 0.52
RABGGTA-201ENST00000216840 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
RABGGTA-201ENST00000216840 RECQL4O94761 1208 aa18.27■□□□□ 0.52
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RABGGTA-201ENST00000216840 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.26■□□□□ 0.51
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RABGGTA-201ENST00000216840 RARAP10276 462 aa18.26■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 VDRP11473 427 aa18.26■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 AKAP5P24588 427 aa18.26■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 PTGIRP43119 386 aa18.26■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 NDST1P52848 882 aa18.26■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa18.26■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 GLRA4Q5JXX5 417 aa18.26■□□□□ 0.51
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